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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/1326| Genetic characterization of “Candidatus Xenohaliotis californiensis” associated with blue (Haliotis fulgens) and yellow abalone (Haliotis corrugata) on the Pacific coast of Baja California Caracterización génetica de la Candidatus Xenohaliotis californiensis, asociada con el abulón azul (Haliotis fulgens) y el abulón amarillo (Haliotis corrugata) sobre la costa del Pacífico de Baja California | |
| Francesco Cicala | |
| AXAYACATL ROCHA OLIVARES | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Candidatus Xenohaliotis californiensis Caracterización genética Microbiota de Haliotis spp. Genetic characterization Microbiota of Haliotis spp. | |
| Las poblaciones de abulón que viven en la costa del Pacífico de la península de Baja California (México), han estado sujetas a eventos de mortandad masiva. Dichos eventos pueden relacionarse con diferentes causas incluyendo el síndrome de deshidratación (o WS por sus siglas en inglés), que es una enfermedad de debilitamiento crónica que afecta a la mayoría de las especies de abulón de Norte América. “Candidatus Xenohaliotis californiensis” (o CXc) ha sido descrito como el agente etiológico de este síndrome. Sin embargo, su papel en el desencadenamiento de esta enfermedad no está totalmente entendido. Al respecto, la ausencia (o presencia) de CXc en abulones enfermos (o sanos) así como diferentes tasas de susceptibilidad y mortalidad, han sido ya reportadas entre las diferentes especies de abulón. Posiblemente, estas observaciones se pueden relacionar con: (i) la existencia de diferentes cepas genéticas de CXc, la cuales podrían diferir por su patogenicidad y con (ii) la presencia de microbiotas alternativos los cuales podrían prevenir la infección por parte de CXc. El día de hoy, ambas consideraciones han sido escasamente investigadas. En relación a esto, CXc es todavía una bacteria no cultivable y el gen 16S rRNA ha sido el único secuenciado hasta la fecha. Este limitado conocimiento genético representa uno de los principales obstáculos en la comprensión de las características ecológicas y biológicas de esta bacteria. Además, no existe información sobre las microbiotas que albergan las especies Mexicanas de abulón. Como consecuencia, los objetivos principales de esta tesis doctoral son ampliar el conocimiento genético de CXc y evaluar la comunidad bacteriana en la cual CXc vive. En el capítulo 3, se propone con éxito un acercamiento independiente de cultivo con el cual fue posible amplificar y secuenciar seis loci codificantes y no codificantes anteriormente desconocidos de este procariota. Esta nueva información genética, fue inicialmente utilizada para aclarar la sistemática y las relaciones evolutivas entre CXc y otras bacterias genéticamente cercanas. Las reconstrucciones filogenéticas más confiables colocan a CXc como un taxón-hermano de Neorickettsia lo cuales forman un linaje basal recíprocamente monofilético a las otras Anaplasmataceae. Además, de acuerdo con los resultados de la línea temporal evolutiva, CXc puede ser considerado como el taxón más basal dentro de las Anaplasmataceae, lo cual apoya la hipótesis de un origen marino de esta familia Abalone populations inhabiting the Pacific coast of Baja California peninsula (Mexico) have experienced unusual mortality events. Such events may have been associated with different causes including the withering syndrome (WS), a chronic wasting disease affecting most if not all North American abalone species. The etiological agent of this syndrome has been described as “Candidatus Xenohaliotis californiensis” (or CXc,). Nevertheless, its role in triggering this syndrome is not completely understood. Indeed, the absence (or presence) of CXc in diseased (or healthy) abalone as well as different susceptibility and mortality rates among abalone species have been previously reported. These observations may be related to: (i) the existence of different CXc genetic strains differing in their pathogenicity and/or; (ii) the presence of alternative microbiota arrangements which may prevent infections by CXc. Thus far, both considerations have been poorly investigated. In this context, CXc remains an uncultured bacterium and the 16S rRNA gene has been the only gene sequenced to date. This limited genetic knowledge represents one of the main obstacles in understanding several ecological and biological features of this bacterium. Also, no information exists about the microbiota composition harbored by Mexican abalone species. Consequently, the main goal of this doctoral dissertation is to extend the genetic knowledge of CXc and assess the bacterial community in which CXc lives. In Chapter 3, I successfully applied a cultureindependent approach in order to amplify and sequence six previously unknown coding and non-coding loci of this prokaryote. This new genetic information, was initially used to clarify the systematic positions and the evolutionary relationship between CXc and other genetically close bacteria. Our most reliable phylogenetic reconstructions place CXc as a sister-taxon of Neorickettsia forming a basal lineage reciprocally monophyletic to the rest of Anaplasmataceae. Moreover, according to our evolutionary timeline, CXc may be considered as the most basal Anaplasmataceae, which supports a marine origin of this bacterial family. In Chapter 4, I used two sequence typing approaches to analyze the genetic diversity of CXc at different levels, namely geographically among fishing cooperatives from Baja California Sur in the blue and yellow abalone, among host species (blue, yellow, and red abalone), and between healthy blue and yellow abalone and those with W | |
| CICESE | |
| 2017 | |
| Tesis de doctorado | |
| Inglés | |
| Cicala, F. 2017. Genetic characterization of “Candidatus Xenohaliotis californiensis” associated with blue (Haliotis fulgens) and yellow abalone (Haliotis corrugata) on the Pacific coast of Baja California. Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 79 pp. | |
| BIOLOGÍA MOLECULAR DE MICROORGANISMOS | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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| Thesis_Francesco_Cicala_Final_30_may_2017.pdf | Versión completa de la tesis | 2.54 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |