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Análisis in silico de microRNAs secretados en diferentes sistemas de estudio: Explorando posibles determinantes para el empaquetamiento exosomal
In silico analysis of microRNAs secreted in different study systems: Exploring determinants for exosomal packaging
RICARDO DE JESUS EHECATL GOMEZ REYES
KRISTINA MARIE HERBERT
Acceso Abierto
Atribución
microRNAs
Bioinformática
Vesículas extracelulares
El interés por estudiar microRNAs (miRNAs) en varios metazoarios se debe al potencial de estas biomoléculas para modular procesos que involucran el desarrollo celular, a partir de su función en la regulación de los niveles proteicos. Un tema emergente de gran interés es la secreción al medio extracelular de miRNAs y su posible función (en analogía con las citocinas y factores de crecimiento, ambas proteinas de señalización extracelular) en la comunicación entre células de un mismo tejido (señalización autócrina) o en la comunicación del sistema inmune con patógenos (e inversamente) o células infectadas (señalización parácrina). Se ha reportado que los miRNAs son selectivamente empaquetados y dirigidos vía exosomas para reprogramar la expresión genética de las células blanco a las cuales estas vesículas van dirigidas. Aunque muchos reportes sugieren que los miRNAs de carga exosomal pueden implementarse para el diagnóstico y/o terapia de diversas enfermedades incluyendo cáncer, aun se sabe poco sobre los factores que determinan el empaquetamiento de miRNAs dentro de exosomas. Existen sin embargo una gran cantidad de datos de proteómica y transcriptómica publicados en bases de datos de libre acceso, que pueden ser re-analizados para responder a hipótesis inspiradas en preguntas básicas respecto al empaquetamiento de proteínas y RNA en exosomas.
MicroRNAs (miRNAs) play a great role in the regulation of cellular protein levels during cell development. Therefore there is large interest in studying them in several metazoa. An emerging topic of great interest is the secretion of miRNAs into the extracellular space and their possible function (in analogy with cytokines and growth factors, both extracellular signaling proteins) in cell-to-cell communication within the same tissue (autocrine signaling) or in the communication of the immune system with pathogens (and vice versa) or infected cells (paracrine signaling). MiRNAs have been reported to be selectively packaged into exosomes, which are then secreted and may reprogram the genetic expression of target cells which abosrb these vesicles. Although many reports suggest that the exosomal miRNAs can be utilized for the diagnosis and/or therapy of various diseases including cancer, little is known about the factors that determine the packaging of miRNAs within exosomes. There is, however, a large amount of proteomics, transcriptomics, and small RNA sequencing data published in open access databases, which can be re-analyzed to answer hypotheses based on fundamental questions regarding the packaging of proteins and RNAs into exosomes.
2016
Tesis de maestría
Español
Gómez Reyes, R.J.E. 2016. Análisis in silico de microRNAs secretados en diferentes sistemas de estudio: Explorando posibles determinantes para el empaquetamiento exosomal. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 89 pp.
BIOLOGÍA MOLECULAR DE MICROORGANISMOS
Aparece en las colecciones: Tesis - Ciencias de la Vida

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