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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/1135| Diversidad microbiana e identificación de genes asociados a la producción de metabolitos secundarios en bacterias asociadas a esponjas marinas Microbialdiversity and identification of genes associated to the production of secondary metabolites in bacteria associated to marine sponge | |
| Ricardo Alberto González Sánchez | |
| Gerardo Toledo Gama | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Diversidad bacteriana,Filogenia,Ciencias del mar,Esponjas | |
| Las esponjas marinas presentan una relación muy estrecha con los microorganismos que las colonizan (simbiontes), muchos de los cuales tienen la capacidad genética de producir compuestos bioactivos que pueden ser de interés comercial. En el presente trabajo se intentó separar las células bacterianas de las células de esponjas a fin de facilitar estudios metagenómicos. Se utilizaron técnicas de electroporación, sonicación y gradientes de Nycodenz™ sin observar una diferencia significativa en ninguno de estos tratamientos. También se estudió la diversidad microbiana asociada a las esponjas marinas Mycale armata y Callyspongia vaginalis por medio de inventarios taxonómicos usados secuencias de 16S y 18S de procariotas y eucariotas respectivamente y mediante técnicas de cultivo en placa. Se detectaron varios grupos bacterianos previamente reportados en esponjas marinas, principalmente proteobacterias de la subclase gamma y alfa (Pseudoalteromonas y Sulfitobacter respectivamente) así como miembros del grupo Bacteroidetes como género Algoriphaga y algunos miembro del dominio Arquea no identificados. Usando agar marino se cultivaron cepas de los géneros Bacillus, Shewanella, Pseudomonas y Psychrobacter. Además se realizaron búsquedas mediantes PCR de genes bacterianos con la producción de metabolitos secundarios tales como policétido sintetasas (PKS tipo I y II), sin encontrar ningún representante. Marine sponges exhibit an important relationship with the microorganisms that coloniza them, many of which have thegenetic capacity of producing bioactive compounds that could have commercial value. In this work it was attempted to separate the bacterial cells from the sponge cells to facilitate metagenomics studies. Electroporation, sonication and Nycodenz™ gradients were used for cell separation and no significant differenceswere observed. Also the microbial diversity associated to the marine sponges Mycale armata and Callyspongia vaginalis was studied by 16S and 18S genesequences to construct taxonomic inventories and also by agar plating techniques. Bacterial groups previously reported to be associated with spongeswere detected. These belonged to the Gamma and Alpha subclasess of proteobacteria, such as Pseudoalteromonas and Sulfitobacter respectively. Additionally, there were found members from the Bacteroidetes group like the genera Algoriphaga and some unidentified Archaea. The bacterial genera detected in clone libraries were not isolated in agar plates and only strains from Bacillus, Shewanella, Pseudomonas and Psychrobacter were cultivated. PKS type Iand II were attempted to be amplified by PCR from environmental samples without success | |
| CICESE | |
| 2006 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| González Sánchez, R.A.2006.Diversidad microbiana e identificación de genes asociados a la producción de metabolitos secundarios en bacterias asociadas a esponjas marinas.Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.79 pp. | |
| MICROBIOLOGÍA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ciencias |
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