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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/1136| Efecto de SinR en aprE y su función en la regulación transcripcional en Bacillus subtilis SinR effect in aprE and their function in transcriptional regulation in Bacillus subtilis | |
| Alejandro Sánchez González | |
| JORGE OLMOS SOTO | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Bacillus subtilis,Genes,Bioinformática,Regulación transcripcional | |
| El gen aprE de Bacillus Subtilis codifica para la proteasa extracelular alcalina subtilisina, su expresión está regulada por una red compleja de activadores y represorestranscripcionales, entre los que se encuentran: SinR, SpoOA, AbrB, Hpr, Siendo SinR uno de los mas importantes. Para determinar el efecto de SinR, sobre laexpresión del gene aprE y para tratar de conocer su función en la regulación transcripcional en B. subtilis, se construyeron cepas de B. subtilis conmutaciones por remoción mutaciones puntuales en la región reguladora de aprE donde se une SinR y se estudiaron los efectos causados por las mutaciones, bajodistintos fondos genéticos. También se utilizaron herramientas bioinformáticas como alineamientos de secuencias y el programa regulon-DB para estudiar lafunción de SinR en la regulación transcripcional de aprE. Analizamos la relación de los reguladores transcipcionales AbrB, Degu, SpoOA, Hpr y Sinlin-vivo aplicando el sistema de dos-híbridos bacteriano para analizar la posible interacción de SinR con otros factores y su efecto sobre aprE, resultando en el diseño de un molde de regulación de la expresión genética correspondiente, lo cual permitió entender mejor la función global y losprocesos de reconocimiento y pegado de SinR. Asimismo, encontramos un nuevo sitio de unión in-vivo para SinR en aprE. Bacillus Subtilis aprE gene codifies for the subtilisin alkaline extracellular protease, its expression is regulated by acomplex network of transcriptional activators and repressors, between which are: SpoOA, AbrB, Hpr, Sinr, beging SinR one of the principal. In order todetermine the effect of SinR, on the expression of aprE gene and trying to know their function in the global transcripcional regulation inn B. subtilis, weconstructed strains of B. subtilis with remotion and punctual mutations in the SinR biding site on aprE and we studied the effect caused by the mutations,under different genetic back grounds. We also used bioinformatics tools as sequences alignments and Regulon-DB program to studied the SinR mechanism offunction in aprE transcriptional regulation. We also analyzed the in-vivo interaction of the transcriptional regulators AbrB, SpoOA, DegU, Hpr and Sinlusing the bacterial two-hybrids system to analyze the possible interaction of SinR with other factors and those effects on aprE, resulting in the design of aregulation model of the corresponding genetic expression, which allowed us to understand better the global mechanism of SinR function. We found a new in-vivo SinRbinding site in aprE | |
| CICESE | |
| 2003 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| Sánchez González, A.2003.Efecto de SinR en aprE y su función en la regulación transcripcional en Bacillus subtilis.Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.102 pp. | |
| MICROBIOLOGÍA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ciencias |
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