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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/1264| Variabilidad genética de Isostichopus fuscus (Ludwig, 1875) en el Pacífico mexicano, mediante marcadores moleculares Genetic variability of Isostichopus fuscus (Ludwig, 1875) in the Mexican Pacific, using molecular markers | |
| JOSE MIGUEL OCHOA CHAVEZ | |
| AXAYACATL ROCHA OLIVARES | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| pepino de mar, diversidad genética, estructura genética | |
| Isostichopus fuscus se distribuye desde el Golfo de California hasta las costas de Ecuador y las Islas Galápagos. Esta holoturia de hábitos sedentarios se encuentra principalmente en fondos someros y presenta una lenta tasa de crecimiento así como una edad de primera madurez tardía, lo que la convierte en una especie susceptible a la sobreexplotación. Su alto valor comercial ha favorecido la sobre explotación ocasionando una notable disminución en el tamaño de su población. Actualmente la especie se encuentra enlistada en la NOM-059-SEMARNAT-2010 como especie sujeta a protección especial y en la Lista Roja de la UICN en peligro de extinción. A pesar de su importancia para efectos de conservación y manejo, la diversidad genética de I. fuscus ha sido muy poco estudiada a lo largo de su distribución. El objetivo de este trabajo es evaluar la diversidad, estructura y conectividad genéticas de I. fuscus en el Pacífico mexicano para conocer si las poblaciones funcionan como una o varias unidades evolutivas independientes. Para esto se diseñaron y caracterizaron 19 marcadores microsatélites polimórficos específicos para I. fuscus. Ocho de ellos, más un fragmento de la región control mitocondrial (RCM) fueron amplificados para 307 y 151 individuos respectivamente, distribuidos a lo largo del Golfo de California. Además se integraron al análisis las secuencias de la RCM provenientes de Ecuador y Galápagos. Los resultados mostraron valores elevados de diversidad genética en términos de diversidad haplotípica (0.99), número de alelos (2-24) y heterocigosis (HO, 0.16-1; HE, 0.32-0.97), así como una estructuración marcada entre México y Sudamérica, y ausente entre las localidades mexicanas. El flujo genético fue mínimo entre México y Sudamérica, y órdenes de magnitud mayor en México. El modelo de dispersión pasiva corroboró el flujo en el sentido horizontal y revela un una importante conectividad vertical. Los resultados indicacaron que dentro del Golfo de California existe una población panmíctica con elevada diversidad genética, cuyo flujo genético ha disminuido posiblemente por la disminución del tamaño poblacional. La alta diversidad y ausencia de estructura genética podrían ser efecto de la conectividad vertical, a través de los individuos en profundidades inaccesibles para la pesquería. Isostichopus fuscus is distributed from Gulf of California to Ecuador and Galapagos Islands. This sedentary sea cucumber is found mainly in shallow depths. A slow growth rate, as well as late maturity makes this species susceptible to overexploitation. Its high commercial value has favored exploitation to unsustainable levels, causing a notorious decrease in population size. At present I. fuscus is included in the Official Mexican Standard NOM-059-SEMARNAT-2010 as subject to special protection and listed as Endangered in the IUCN Red List. Despite its importance in terms of management and conservation, its genetic status has been little studied along its distribution range. The objective of this thesis was to evaluate genetic diversity, structure and gene flow in the Mexican Pacific in order to establish whether populations work as a single or many independent evolutionary units. For this we designed 19 species-specific polymorphic microsatélite markers. Eight of them plus a mitochondrial control region fragment (mtCR) were amplified for 307 and 151 individuals, respectively, distributed along the Gulf of California. Mitochondrial control region sequences from Ecuador and Galapagos were added to the analysis. Results show high genetic diversity values in terms of haplotype diversity (0.99), number of alleles (2-24) and heterozygosity (HO, 0.16-1; HE, 0.32-0.97). A marked genetic differentiation between Mexico and South America was detected, as well as the absence of differentiation among samples from Mexico. Gene flow was minimal between Mexico and South America, and several orders of magnitude larger in Mexico. An oceanographic model of dispersal corroborates horizontal flux and reveals an important amount of vertical connectivity. Results indicate the presence of a single panmictic I. fuscus population in the Gulf of California with high genetic diversity, whose gene flow has diminished possibly as a result of population declines. The high genetic diversity and absence of structure could be the result of vertical connectivity of individuals inhabiting water depths inaccessible to the fishery. | |
| CICESE | |
| 2017 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Ochoa Chávez, J. M. 2017. Variabilidad genética de Isostichopus fuscus (Ludwig, 1875) en el Pacífico mexicano, mediante marcadores moleculares. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 73 pp | |
| BIOLOGÍA Y QUÍMICA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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|---|---|---|---|---|
| TesisGenéticaIfuscus_Ochoa2017.pdf | Versión completa de la tesis | 1.8 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |