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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/1520| Evaluación morfológica y molecular de la diversidad de nemátodos marinos de vida libre (Enoplida) en las costas de Baja California Morphological and molecular assessment of the free living marine nematode diversity (Enoplida) from the coasts of Baja California. | |
| TIAGO JOSÉ PEREIRA FELISBINO | |
| AXAYACATL ROCHA OLIVARES | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Baja California,Genética molecular,Ciencias del mar,Código de Barras de ADN,Nemátodos marinos | |
| Determinar la diversidad existente en nuestro planeta es una tarea ineludible y se haconvertido en un reto para las diferentes áreas de la biología. El saber con qué especies setrabaja es parte fundamental de cualquier estudio ecológico y evolutivo. Sin embargo, elesfuerzo involucrado en la determinación taxonómica ha llevado al desarrollo de nuevastécnicas de identificación, como es el código de barras de ADN. En este estudio se evaluóla diversidad morfológica y molecular de la nematofauna marina (Enoplida) en las costasde Baja California, México. Para ello, se utilizó un enfoque holístico contemplando lataxonomía tradicional basada en la morfología y la genética molecular (genes 18S y 28Sdel ADNr) con el objetivo de comparar ambas líneas de evidencia (morfología vs.molecular) así como la utilidad de los genes (18S vs. 28S). Se analizaron un total de 160organismos provenientes de siete localidades representando el Golfo de California y playasdel Pacifico frente a la Península de Baja California. Se identificaron un total de 16 génerosy cinco familias. Las familias más representativas fueron Thoracostomopsidae yOncholaimidae con seis y tres géneros, respectivamente. El género Trileptium fue el másampliamente distribuido ocurriendo en cinco de las localidades. Análisis morfométricosapoyados con los datos moleculares indicaron que este género representa variasmorfoespecies (ANOSIM, p < 0.05). Los resultados morfológicos y moleculares no fueronconcordantes en su totalidad. Se sugiere que las diferencias ontogénicas aunadas a laplasticidad fenotípica dentro del grupo fueron responsables por dicha discordancia. Losgenes utilizados presentaron algunas diferencias en cuestiones prácticas como el éxito enamplificaciones vía PCR y calidad de las secuencias así como en la resolución taxonómica(el gen 28S fue más variable), pero por lo general resultaron en topologías congruentes(ILD, p > 0.05) lo que muestra que ambas regiones pueden ser utilizadas en futurostrabajos de código de barras de ADN para una mejor evaluación de la nematofauna marina.El éxito de este trabajo sugiere que la aplicación de un enfoque holístico podrá ayudar a lamejor evaluación de la diversidad de los nemátodos marinos, particularmente en lugares endonde estos estudios son aún incipientes. Determining the levels of diversity in the biosphere has become an inescapable task andrepresents a considerable challenge for most areas in biology. Knowing the identity of aspecies represents a central part for any ecological and evolutionary study. However, theconsiderable effort needed for taxonomic determination has led to the development of newapproaches, such as DNA barcoding. In this study, the morphological and moleculardiversity of marine nematodes (Enoplida) from the coasts of Baja California, Mexico wasassessed. A holistic approach contemplating traditional morphology-based taxonomy andmolecular genetics (sequences from 18S and 28S rDNA genes) was used in order tocompare both approaches (morphology vs. genetic), and to assess the usefulness of bothgenes (18S vs. 28S). A total of 160 organisms were analyzed from seven localities of thePacific in the Baja California Peninsula and in the Gulf of California. Sixteen genera wereidentified from five Enoplid families. The most representative families wereThoracostomopsidae and Oncholaimidae, with six and three genera, respectively. Thegenus Trileptium (Thoracostomopsidae) was the most widespread being present in fivelocalities. Morphometric analyses supported by molecular results showed that this genusrepresents many morphospecies (ANOSIM, p < 0.05). Morphological and molecular resultswere not completely consistent. We suggest that ontogenetic differences and phenotypicplasticity contributed to the observed discrepancy between morphology and genetics. TherDNA genes 18S and 28S showed some differences in performance, such as PCR successand the quality of DNA sequence data, as well as in taxonomic resolution (28S was morevariable), but in general both topologies were congruent (ILD, p > 0.05) indicating that,both genes can be used for future DNA barcoding aimed at a better assessment of themarine nematofauna. The successful results of this study suggest that a holistic approachcan play a significant role in the proper assessment of the diversity of marine nematodes,particularly in places where this research is still incipient. | |
| CICESE | |
| 2008 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Pereira,T.J.2008.Evaluación morfológica y molecular de la diversidad de nemátodos marinos de vida libre (Enoplida) en las costas de Baja California.Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.118 pp. | |
| PECES Y FAUNA SILVESTRE | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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