Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/1875| Diversidad y estructura genética de la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus) en la región central del Golfo de California Diversity and genetic structure of the lion’s paw scallop (Nodipecten subnodosus) from the central region of the Gulf of California | |
| BRENDA PRISCILA OVIEDO VELAZQUEZ | |
| FABIOLA LAFARGA DE LA CRUZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Nodipecten subnodosus, microsatélites, diversidad genética, estructura genética, Golfo de California. Microsatellites, genetic diversity, genetic structure, Gulf of California. | |
| El pectínido Nodipecten subnodosus representa un recurso acuícola importante. Sin embargo, su importancia económica ha generado que sus poblaciones naturales estén actualmente reducidas o casi completamente agotadas. El objetivo de este trabajo fue caracterizar genéticamente a poblaciones silvestres y un lote de cultivo, evaluando el grado de diferenciación entre ellas. Se realizó una prospección en 60 sitios distribuidos en la región central del Golfo de California (GC) y se obtuvieron muestras de cuatro localidades: Bahía de los Ángeles (BLA), Punta El Soldado (PSO), Bahía de las Ánimas (ANI) y San Francisquito (SFR); adicionalmente se analizaron muestras procedentes de Isla Natividad (NAT) en la costa Pacífico (CP), además de un lote de juveniles de cultivo (F1 de Bahía de las Ánimas). Se amplificaron diez microsatélites especie-específicos mediante la técnica de PCR y se obtuvo una matriz de genotipos mediante análisis de fragmentos con electroforesis capilar de alta resolución. Posteriormente, se determinó la diversidad genética expresada en número de alelos (Na), riqueza alélica (Ra), heterocigosidad observada (Ho) y esperada (He), coeficiente de endogamia (FIS) y equilibrio de Hardy-Weinberg (EHW) con programas genéticos (GENALEX, FSTAT, GENEPOP). Para detectar estructura genética poblacional se calcularon los valores pareados de FST (ARLEQUIN), componentes genéticos (STRUCTURE y STRUCTURE HARVESTER), así como la dirección y magnitud del flujo genético (MIGRATE). Inicialmente se observó que la abundancia de este bivalvo se vio reducida, ya que a pesar del esfuerzo de prospección se encontraron muy pocos organismos en el área de estudio. En general, se encontró una moderada diversidad genética dentro del área de estudio (Na = 2 - 12, Ra = 3.815, Ho = 0.60, He = 0.75). Los mayores valores de diversidad se detectaron en ANI (Ra = 4.096) y los menores en SFR (Ra = 3.303). Se observó un déficit de heterocigotos, que puede estar relacionado a la presencia moderada de alelos nulos. La variabilidad genética estuvo distribuida de forma homogénea en todas las localidades, por lo que no se observó estructura genética. Lo anterior, fue probablemente debido al fuerte flujo genético en dirección norte a sur, por el patrón de corrientes durante la época reproductiva. Los valores pareados de FST únicamente mostraron diferenciación, aunque relativamente baja, entre BLA y NAT (FST = 0.023) y entre ANI y NAT (FST = 0.038). The scallop Nodipecten subnodosus represents an important aquaculture resource. However, its economic importance has led to an overexploitation and their natural populations are currently reduced or almost completely depleted. The objective in this work was to genetically characterize populations in the wild and a cultured lot by evaluating the genetic variability between them. A survey was conducted in 60 sites distributed along the central region of the Gulf of California (GC) and samples were obtained at four locations: Bahia de los Angeles (BLA), Punta El Soldado (PSO), Bahia de las Animas (ANI) and San Francisquito (SFR). In addition, samples from Isla Natividad (NAT) on the Pacific coast (CP) were analyzed, as well a batch of hatchery-reared scallops (F1 from Bahía de las Animas). Ten species-specific microsatellites were amplified using the PCR technique and a genotype matrix was obtained by fragment analysis using high-resolution capillary electrophoresis. Subsequently, the genetic diversity expressed in number of alleles (Na), allelic richness (Ra), observed and expected heterozygosity (Ho, He), inbreeding coefficient (FIS) and Hardy-Weinberg equilibrium (EHW) was calculated with genetic programs (GENALEX, FSTAT, GENEPOP). To detect population genetic structure, the paired values of FST (ARLEQUIN) and genetic components (STRUCTURE and STRUCTURE HARVESTER) were calculated, as well as the direction and magnitude of the genetic flow (MIGRATE). Initially it was observed that the abundance of this bivalve was reduced, in spite of the prospecting effort, very few organisms were found in the study area. In general, a moderate genetic diversity was found within the study area (Na = 2 - 12, Ra = 3.815, Ho = 0.60, He = 0.75). The highest values of diversity were detected in ANI (Ra = 4.096) and the lowest in SFR (Ra = 3.303). A deficit of heterozygotes was observed, which may be related to the moderate presence of null alleles. The genetic variability had an even distribution in all locations, so no population genetic structure was observed. This was probably due to the strong genetic flow in north-south direction, due to the pattern of currents during the breeding season. The paired values of FST only showed differentiation, although relatively low, between BLA and NAT (FST = 0.023) and between ANI and NAT (FST = 0.038). | |
| CICESE | |
| 2017 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Oviedo Velázquez, B.P. 2017. Diversidad y estructura genética de la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus) en la región central del Golfo de California. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 70 pp. | |
| GENÉTICA DE POBLACIONES | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Acuicultura |
Cargar archivos:
| Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
|---|---|---|---|---|
| tesis_Oviedo_Velázquez_Brenda_Priscila_04_dic_2017.pdf | Versión completa de la tesis | 2.71 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |