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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2196| Caracterización molecular del complejo principal de histocompatibilidad clase I en la vaquita (Phocoena sinus) CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DEL COMPLEJO PRINCIPAL DE HISTOCOMPATIBILIDAD CLASE I EN LA VAQUITA (Phocoena sinus). | |
| Aines del Carmen Castro Prieto | |
| Horacio Jesús de la Cueva Salcedo SERGIO FRANCISCO FLORES RAMIREZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Complejo Principal de Histocompatibilidad,MHC clase I, Phocoena sinus, Ciencias del mar, Major Histocompatibility Complex, MHC class I, Phocoena sinus | |
| Phocoena sinus la Vaquita, un cetáceo endémico del Alto Golfo de California y muy amenazado es un buen modelo para estudiar corno la selección natural y la historia demográfica han moldeado el polimorfismo del Complejo Principal de Histocompatibilidad (Mhc) en poblaciones pequeñas de cetáceos y otros animales que muestran diversidad genética reducida. El análisis de la variabilidad de los genes sujetos a selección como el Zlflzc es relevante en la conservación dc especies. Se aislaron y caracterizaron secuencias que codifican la región de unión al péptido (PBR) y se utilizaron análisis filogenéticos para segregar las secuencias obtenidas en linajes alélicos potenciales indicativos de la especificidad del locus. Las secuencias que pertenecieron a un linaje alélico potencial (locus) se alinearon para detectar regiones conservadas de un solo locus que flanquean los exones 2 y 3 de las secuencias Mhc-l aisladas, candidatas para el diseño de oligonucleótidos específicos para la especie. Finalmente se realizó un análisis preliminar del polimorfismo M710-I en cuatro individuos. Se emplearon PCR, clonación, análisis SSCP's y secuenciación automatizada para aislar y caracterizar secuencias variables que codifican la PBR de MHC-I a partir de dos vaquitas. The vaquita Phocoena sinus, the endemic porpoise from the Gulf of California is critically endangered and represents an outstanding model to study how selection and historical demography have shaped the Major Histocompatibility Complex (Mhc) polymorphism in reduced cetacean and other species populations displaying low genetic diversity. The polymorphism analysis of genes subject to selection like those of the Mhc is relevant for the conservation of natural populations. We aimed to isolate and characterize class I sequences encoding the PBR and used the most updated phylogenetic analyses to segregate obtained sequences into putative allelic lineages indicative of locus specificity. Sequences belonging to putative single allelic lineage (locus) were aligned to detect conserved locus specific regions flanking the variable exon 2 and 3 Mhc-I sequences, candidates for oligonucleotide primers design. Finally, we conducted a preliminary assessment of their polymorphism in 4 individuals. Thus, we used Polymerase Chain Reaction, Cloning, SSCP's analysis and Automated Sequencing to isolate and characterize variable exon 2 and 3 Mhc-I sequences encoding the PBR from two vaquitas. | |
| CICESE | |
| 2006 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Castro Prieto, A. C.2006.Caracterización molecular del complejo principal de histocompatibilidad clase I en la vaquita (Phocoena sinus).Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.112p. | |
| PECES Y FAUNA SILVESTRE | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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