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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2517| Bacterias asociadas a muestras de sedimentos y zooplancton en el Golfo de México Bacteria associated to sediment and zooplankton samples from the Gulf of Mexico | |
| PABLO BRAVO BAAS | |
| MARCIAL LEONARDO LIZARRAGA PARTIDA | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Vibrio, bacterias degradadoras de hidrocarburos, Golfo de México, PCR, qPCR, sondas, cólera Vibrio, hydrocarbon degrading bacteria, Gulf of Mexico, PCR, qPCR, probes, cholera | |
| Las masas de agua que alimentan al Golfo de México (GM) entran principalmente a través del canal de Yucatán, formando a nivel superficial (<400 m) la corriente de rizo en su extremo este y la cual abandona al GM a través del estrecho de Florida. A mayor profundidad, se detecta en la parte oeste del Golfo otras masas de agua, donde la profunda del Atlántico Norte se detecta a partir de los 1000 m. Debido a la riqueza en hidrocarburos en todo el GM, la extracción de petróleo ha sido constante, incrementando el riesgo de un derrame, como el que ocurrió en la plataforma Deepwater Horizon en 2010. Los estudios bacteriológicos efectuados en el GM se han enfocado en las bacterias que intervienen en la degradación del petróleo, y en zonas estuarinas y costeras en bacterias patógenas para el humano como algunas del género Vibrio. Se sabe que el zooplancton representa un reservorio para estos organismos patógenos cerca de zonas costeras, sin embargo, no se ha comprobado si esta asociación se detecta en mar abierto, y tampoco si el zooplancton funge como reservorio para bacterias degradadoras de hidrocarburos (BDH). Debido a lo anterior, en el presente trabajo se determinó la presencia y abundancia de las BDH (Marinobacter spp., Alcanivorax spp. y Cycloclasticus spp.) y de vibrios (Vibrio spp., V. cholerae, V. cholerae ctxA+, V. parahaemolyticus, V. parahaemolyticus tdh+, V. vulnificus y V. alginolyticus) en muestras de zooplancton y sedimento colectadas en el GM durante las campañas oceanográficas XIXIMI-04 (XIX-04) y 05 (XIX-05). Se extrajo DNA genómico para el análisis de las muestras por PCR punto final y qPCR con SYBRgreen I y sondas Taqman, para determinar la presencia y cuantificar la abundancia de las especies estudiadas. No se encontraron BDH asociadas al zooplancton en ambos cruceros, pero se detectó la presencia de vibrios asociados a zooplancton y sedimentos en XIX-04 y sólo en sedimento en XIX-05. En muestras de zooplancton de XIX-04 se detectó la presencia de V. alginolyticus, V. parahaemolyticus toxigénico (tdh+), V. cholerae y V. cholerae toxigénico (ctxA+). Con base en los resultados obtenidos, se concluyó que el zooplancton no representa un nicho idóneo para BDH, pero sí para vibrios, constituyendo la primera evidencia de que vibrios patógenos para el ser humano, como V. alginolyticus, V. parahaemolyticus y V. cholerae, pueden encontrarse asociados al zooplancton en aguas oceánicas del Golfo de México y no sólo en zonas costeras, lo que ... Surface water masses (<400 m) that feed the Gulf of Mexico (GM) come from the Caribbean Sea and enter through the Yucatan Channel forming the loop current and leaving the GM through the Florida Strait. At levels deeper than 400 m different water masses are detected. Due to the GM oil richness, there has been a constant oil extraction, an industry that has increased the risk of an accident like the Deepwater Horizon in the US GM waters, in 2010. The bacteriological studies performed in the GM has been focused on hydrocarbon-degrading bacteria (HDB) or on pathogenic bacteria such as Vibrio spp. Several reports indicate that zooplankton is a reservoir for pathogenic vibrios in estuarine and coastal zones, but this association has not been detected in the open sea. It is also unknown if zooplankton is a niche for (HDB). Therefore, in the present study, selected HDB such as Marinobacter spp., Alcanivorax spp. and Cycloclasticus spp. as well as vibrios (Vibrio spp., V. cholerae, V. cholerae ctxA+, V. parahaemolyticus, V. parahaemolyticus tdh+, V. vulnificus y V. alginolyticus) were studied from zooplankton and sediment samples, collected in the GM during the oceanographic cruises XIXIMI-04 (XIX-04) and XIXIMI-05 (XIX-05). Extracted DNA from zooplankton and sediment samples was used to detect the presence and abundance of those organisms with the endpoint PCR and qPCR with SYBRgreen I dye and Taqman probes techniques. The presence of HDB were not detected in zooplankton samples from XIX-04 and XIX-05, Nevertheless, vibrio species have been found in XIX-04 zooplankton and sediment samples in both oceanographic cruises. Human pathogenic vibrios such as V. alginolyticus, V. parahaemolyticus (tdh+), V. cholerae and V. cholerae ctxA+, have been detected in zooplankton samples. Therefore, zooplanktonic organisms are not a niche for HDB, as they are for vibrios. In this study, for the first time, pathogenic vibrios for humans were detected in zooplankton samples collected in the open waters of the Gulf of Mexico. This finding represents another vector of transmission of pathogenic organisms, besides the ballast water and the biofouling attached to commercial ship hulls. | |
| CICESE | |
| 2018 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Bravo-Baás, P. 2018. Bacterias asociadas a muestras de sedimentos y zooplancton en el Golfo de México. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 54 pp. | |
| BACTERIOLOGÍA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ciencias de la Vida |
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| tesis_Bravo Baás_ Pablo_15_oct_2018.pdf | Versión final de la tesis | 2.34 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |