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Estudio in silico de L-asparaginasas de Streptomyces para la identificación de potenciales candidatas para el tratamiento de la Leucemia Linfocítica Aguda
Bioinformatic study of L-asparaginases from Streptomyces to identify potential candidates for the treatment of Acute Lymphoblastic Leukemia
IVAN GONZALEZ TORRES
ALEJANDRO HUERTA SAQUERO
Acceso Abierto
Atribución
L-asparaginasa, Streptomyces, inmunogenicidad
L-asparaginase, Immunogenicity, Streptomyces
La L-asparaginasa tipo II de Escherichia coli es una enzima esencial en el tratamiento de la leucemia linfoblástica aguda. Tras su administración, el nivel de L-asparagina en el torrente sanguíneo se reduce y conduce a la apoptosis de los linfoblastos leucémicos debido a que son incapaces de sintetizar el aminoácido. Sin embargo, la alta inmunogenicidad de la enzima es la principal limitante para su uso y, aunada a su actividad L-glutaminasa, disminuye la eficacia del tratamiento. En este trabajo se identificaron, seleccionaron y caracterizaron L-asparaginasas de microorganismos del género Streptomyces con base en análisis bioinformáticos de su secuencia de aminoácidos, su perfil inmunogénico, modelado por homología y su afinidad por la L-asparagina. Finalmente, se propuso un modelo estructural y dos posibles sitios activos para una L-asparaginasa de Streptomyces scabrisporus, no caracterizada y que forma parte de una familia de proteínas poco estudiada. La baja inmunogenicidad y buena afinidad por la asparagina de la L-asparaginasa de Streptomyces scabrisporus predicha, permite proponerla como alternativa para el tratamiento de la leucemia linfocítica aguda.
The enzyme L-asparaginase from Escherichia coli is a therapeutic enzyme that has been a cornerstone in the clinical treatment of acute lymphoblastic leukemia for the last decades. However, treatment effectiveness is limited by the highly immunogenic nature of the protein and its dual-substrate activity towards L-glutamine. In this work, a bioinformatic approach was used to identify, select and characterize L-asparaginases from Streptomyces through sequence-based screening analyses, immunoinformatics, homology modeling and molecular docking studies. Furthermore, two putative binding sites and a 3D model were proposed for a previously uncharacterized L-asparaginase from Streptomyces scabrisporus. The predicted low immunogenicity and good affinity for asparagine of L-asparaginase from Streptomyces scabrisporus allows us to propose it as an alternative for the treatment of acute lymphocytic leukemia.
CICESE
2018
Tesis de maestría
Español
González Torres, I. 2018. Estudio in silico de L-asparaginasas de Streptomyces para la identificación de potenciales candidatas para el tratamiento de la Leucemia Linfocítica Aguda. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 60 pp.
INMUNOQUÍMICA
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