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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2548
Análisis de la diversidad de microorganismos halófilos con potencial para degradar contaminantes ambientales Analisys of diversity of halophilic microorganisms with potential to degrade enviromental pollutants | |
Ricardo Cruz López | |
SYLVIE LE BORGNE | |
Acceso Abierto | |
Atribución | |
Microorganismos halófilos, Biodegradación, Hidrocarburos, DGGE, Ciencias del mar, Halophilic microorganisms, biodegradation, hydrocarbons | |
En este trabajo se evaluó la capacidad de comunidades de microorganismos halófilos provenientes de aguas de producción de la industria petrolera y de un sistema lagunar salino sin historial de contaminación para degradar hidrocarburos. Después de un proceso de aclimatación de 9 meses, se inició una segunda fase de cribado de 3 meses donde se hizo el seguimiento de la producción de CO2 y la determinación del consumo de hidrocarburos pesados y aromáticos por medio de cromatografía de gases acoplada a un detector de ionización de flama (GC-FID) y cromatografía líquida de alto desempeño (HPLC). Por medio de los ensayos a nivel microcosmos se encontró que el incremento en la salinidad da como resultado un decremento en la capacidad para metabolizar los hidrocarburos. Utilizando técnicas dependientes e independientes de cultivo se buscó determinar las poblaciones presentes en los microcosmos en función del hidrocarburo y de la salinidad del medio. Por medio de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se amplificó la región hipervariable V3-V5 del gen del 16S rRNA usando primers universales para bacterias. Los perfiles de PCR-Electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE) fueron analizados usando el índice de similitud de Dice y un posterior análisis de agrupamiento UPGMA expresado en un dendograma. Los dendogramas demostraron que las poblaciones son diferentes entre salinidades y entre fuente de carbono utilizada. In this study, we evaluated the capacity of halophilic microbial communities from petroleum industry production waters and a saline lagoon system without history of contamination to degrade hydrocarbons. After a first screening period of nine months, we began a second phase of screening for three months where determinations of CO2 were performed and consume of heavy weight and aromatic hydrocarbons from microcosm experiments utilizing Gas Chromatography coupled to a Flame Ionization Detector (GC-FID) and High Performance Liquid Chromatography (HPLC). By this first microcosm attempt we found that the increase of salinity limits the capacity of microorganisms to metabolize hydrocarbons as sole source of carbon. Performing culture dependent and independent molecular techniques we obtained halophilic microbial community profiles present in the microcosms. Using PCR technique we amplified the V3-V5 region of 16S rRNA gene using bacterial universal primers. The obtained PCR-DGGE profiles were analyzed using the Dice´s index of similarity and cluster analysis UPGMA expressed as dendograms. The dendograms showed that microbial populations were different depending on the salinity and the hydrocarbons used as sole source of carbon. | |
CICESE | |
2008 | |
Tesis de maestría | |
Español | |
Cruz López, R.2008.Análisis de la diversidad de microorganismos halófilos con potencial para degradar contaminantes ambientales.Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.115 pp. | |
MICROBIOLOGÍA | |
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