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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2786| Estudio de las comunidades microbianas asociadas a ambientes geotermales de la falla Wagner, golfo de California Study of the microbial communities associated to geothermal environments of the Wagner fault, Gulf of California | |
| ISRAEL MATEO SANCHEZ LEYVA | |
| María Asunción Lago Lestón | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Sedimentos Geotermales, Metagenómica, ARNr 16S, Extremófilos Geothermal Sediments, Geothermal, Metagenomics, 16S rRNA, Extremophiles, High-throughput Sequencing | |
| La falla Wagner es parte del sistema de fallas del golfo de California localizado en la zona norte del golfo. La falla presenta alta actividad termal y de emisión de gases en la frontera este de la cuenca Wagner, lo que la convierte en un sitio de interés para realizar estudios sobre la adaptación microbiana a condiciones extremas. En este trabajo se analizaron muestras de sedimento colectadas durante la campaña oceanográfica Geotermia II realizada de septiembre a octubre del 2015. Se estudiaron muestras tomadas hasta una profundidad de 2.2 metros bajo la superficie del suelo marino y que mostraron gradientes de temperatura a lo largo de la columna sedimentaria, siendo la temperatura máxima registrada de 99 °C en las secciones más profundas. Se analizaron las muestras provenientes de 3 estaciones de muestreo, donde se obtuvieron 2 núcleos por estación, los cuales presentaban diferencias en temperatura entre núcleos. Cada núcleo se seccionó cada 20 centímetros y cada sección fue liofilizada. Para el análisis metagenómico se extrajo el ADN total de 66 muestras independientes, se amplificó la región hipervariable V4 del gen de la subunidad 16S de ARNr y se secuenció utilizando la plataforma MiSeq de Illumina. En total se analizaron un total de 2.2 millones de secuencias, de las cuales se obtuvieron 1,706 OTUs distintos (1,336 bacterianos, 278 de arqueas y 92 sin asignar). Los resultados indicaron que las zonas más calientes presentan una baja diversidad de microrganismos, y que es la profundidad la característica que influye más en el patrón de distribución de la muestra. También se observan diferencias entre las comunidades de los núcleos fríos y los núcleos calientes y a lo largo del perfil de profundidad. Solo las secciones más superficiales, las de los 20 primeros centímetros, son las que mostraron unas comunidades muy parecidas entre todas las estaciones. The Wagner fault is part of the Gulf of California fault system located in the Northern area. This fault has high thermal and gas seepage activities at the Eastern border of the Wagner basin, which makes it an interesting site for the study of microbial adaptation to extreme conditions. In this work, sediment samples collected during the Geotermia II oceanographic campaign (September-October, 2015) were analyzed. The studied samples were taken up to 2.2 meters below the seafloor and with different temperature gradients along the sedimentary column, with the highest temperature registered at 99 °C at the deepest sections. Samples from three sample stations were analyzed, from which were obtained two cores that presented differences in temperature. Each core was sectioned every 20 centimeters and each section was lyophilized. For metagenomic analysis, total DNA from 66 independent samples was extracted; the hypervariable region V4 was amplified from the 16S rRNA subunit and, the samples were sequenced using the Illumina MiSeq platform. A total of 2.2 million sequences were analyzed from which was obtained 1,706 OTUs (1,336 bacterial; 278 archaeal; and 92 unassigned). Results showed that the warmer regions have lower microorganism diversity and, that depth is crucial for the distribution pattern of the sample. It also was observed differences between microbial communities in the cold and hot core along the depth profile. Only the more superficial sections, i.e., the first 20 centimeters, showed very similar communities between all stations. | |
| CICESE | |
| 2019 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Sánchez Leyva, I.M. 2019. Estudio de las comunidades microbianas asociadas a ambientes geotermales de la falla Wagner, golfo de California. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 47 pp. | |
| MICROBIOLOGÍA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ciencias de la Vida |
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| Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
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| Tesis_Israel Mateo Sanchez Leyva_22_feb_2019.pdf | Versión completa de la tesis | 6.58 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |