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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3024| Caracterización genética poblacional del abulón negro (Haliotis Cracherodii) en Baja California, México Population genetic characterization of black abalone (Haliotis cracherodii) in Baja California, Mexico | |
| MELINA CEPEDA OCHOA | |
| Fabiola Lafarga de la Cruz | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Abulón negro, Haliotis cracherodii, genética poblacional, heterocigosis, endogamia, cuello de botella, FST, estructura poblacional, migración, Baja California Black abalone, Haliotis cracherodii, populations genetics, heterozygosity, inbreeding, bottleneck, FST, population structure, migration, Baja California | |
| El abulón negro (Haliotis cracherodii) es un recurso de gran importancia ecológica y socioeconómica en California y Baja California. Esta especie esta listada en peligro crítico (Lista Roja de la UICN), ya que, su densidad poblacional disminuyó significativamente a mediados de los 80´s presentando cambios en su distribución geográfica histórica. En California, estudios genéticos poblacionales evidencian que la recuperación natural de este recurso no es posible, dado que la especie presenta una baja dispersión larval que limita el flujo de genes entre localidades. En México, existen pocos estudios sobre su distribución y abundancia; mientras que su estado genético poblacional no ha sido estudiado. Por lo cual, el objetivo de este trabajo fue caracterizar genéticamente el recurso abulón negro (Haliotis cracherodii) en la costa Pacífico de Baja California, México. El área de estudio incluyó seis localidades de muestreo: Bajamar (BJM), Saldamando (SLM), Isla Todos Santos (ITS), Punta Banda (PBD), Faro San José (FSJ) e Isla Guadalupe (IGP) y se colectaron 341 abulones (tallas de 20-120 mm). Se analizaron 240 abulones con ocho marcadores microsatélites especie-específicos, incluidos 41 abulones de dos localidades de California (Andrew Molera (CAM) y Point Arguello (CAR)) descritas anteriormente por Beldade et al. (2012). Se calcularon las frecuencias alélicas, número de alelos (Na), alelos efectivos (Ne), riqueza alélica (Ra), alelos privados (AP), heterocigosidades (Ho, He), coeficiente de endogamia (FIS) y Equilibro de Hardy Weinberg (EHW). El grado de estructura poblacional se determinó mediante la diferencia genética entre pares de localidades (FST) y el número de componentes genéticos (STRUCTURE). Se realizó la prueba de Mantel para evaluar aislamiento por distancia (IBD) y se generó un dendrograma de similitud genética (Dc) entre las localidades evaluadas. Y se evaluó la tasa de migración pasada (MIGRATE) y si existe una reducción reciente en el tamaño efectivo poblacional (BOTTLENECK). Los resultados mostraron un déficit de heterocigotos en todas las localidades (He = 0.917; DE= 0.005; Ho = 0.459; DE= 0.032) y un alto coeficiente de endogamia (FIS= 0.227-0.861; p˂0.05). Las localidades de California resultaron ser genéticamente diferentes a los de Baja California (P˂0.0062); las localidades continentales mostraron similitudes genéticas (P˃0.0062) entre ellas. Mientras que, Isla de Guadalupe evidenció ser genéticamente diferentes de todas (P˂0.0062)... The black abalone (Haliotis cracherodii) is a very valuable resource of ecological and socioeconomic importance; It is listed as critically endangered (IUCN Red List), since the population declined significantly in the mid 80’s along with its geographical distribution. In California, genetic population analyzes warn that the recovery of black abalone will be very difficult due to low larval distribution, which prevents the dispersion of genes to increase genetic variability. In Mexico, there are only a few studies on its distribution and abundance, while the genetic state of the population has not been studied. Therefore, the main objective of this work was to genetically characterize the black abalone (Haliotis cracherodii) in Baja California, Mexico. Six sampling locations from the north to the center of the peninsula were selected: Bajamar (BJM), Saldamando (SLM), Todos Santos Island (ITS), Punta Banda (PBD), San José Lighthouse (FSJ) and Guadalupe Island (IGP), and 341 abalone were collected with a size range of 20 to 120 mm. A total of 240 black abalones were analyzed using eight species-specific microsatellite markers, including 41 abalones from two California locations, Andrew Molera and Point Arguello, described previously by Beldade et al. (2012). The genetic variability of each population was calculated (allelic diversity, effective alleles, allelic richness, heterozygosity, inbreeding coefficient and Hardy Weinberg equilibrium); the distance isolation between pairs of locations: the population structure, the genetic migration, and the phylogeographic relationship. The results showed a heterozygous deficit in all locations (He = 0.917; SD = 0.005; Ho = 0.459; SD = 0.032) and a high inbreeding coefficient (FIS= 0.227-0.861; p˂0.05). Black abalones of California turned out to be genetically different from those of Baja California (P˂0.0062), and those of the continental coast showed genetic similarities between them (P˃0.0062). Whereas, the abalones from Guadalupe island proved to be genetically different from all the others (P˂0.0062). The genetic population structure of California was grouped as a single component; continental localities and Isla Todos Santos were associated in a second group, and the third group was structured with Guadalupe Island. Finally, the phylogeographic relationship formed three clades: 1) CAM and CAR, 2) BJM, SLM, ITS and FSJ and 3) Punta Banda, considering Guadalupe island as an outgroup due to the genetically... | |
| CICESE | |
| 2019 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Cepeda-Ochoa, M. 2019. Caracterización genética poblacional del abulón negro (Haliotis Cracherodii) en Baja California, México. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 89 pp. | |
| GENÉTICA DE POBLACIONES | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Acuicultura |
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