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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3722| Diversidad y flujo génico del pargo seda (Lutjanus peru) en la costa Pacífica de Costa Rica, Panamá y Colombia, mediante marcadores moleculares de microsatélite Diversity and gene flow of silk snapper (Lutjanus peru) on the Pacific coast of Costa Rica, Panama and Colombia, using microsatellite molecular markers | |
| José Luis Molina Quirós | |
| Axayácatl Rocha Olivares | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| conectividad larval, corrientes marinas, flujo génico, Lutjanus peru, picos reproductivos larval connectivity, marine currents, gene flow, Lutjanus peru, reproductive peaks | |
| La costa del Pacífico de Costa Rica, Panamá, y Colombia (COPc-CRPC) se encuentra influenciada por varios sistemas de corrientes marinas regionales y locales, en conjunto con giros altamente dinámicos y estacionalmente cambiantes. Lo anterior, conforma una serie de factores ambientales involucrados en la dispersión o retención de huevos y larvas meroplanctónicas, así como en procesos de dispersión o migración en especies marinas. El pargo seda o huachinango (Lutjanus peru), es una especie costera (e insular) con una biología reproductiva altamente dependiente de ciertas condiciones ambientales que favorecen su estrategia reproductiva de tipo-r. Además, L. peru se constituye como una especie de un alto valor socio-económico a lo largo de su rango de distribución geográfica total. En ese contexto, el objetivo de esta investigación es determinar los patrones de flujo, y estructura génica para L. peru por medio de 13 marcadores moleculares de microsatélite. Para ello se analizó un total de 136 muestras de tejido mismas que provenían, mayoritariamente de pesquerías artesanales, recolectadas en distintos puntos del Pacífico costero de Costa Rica norte, Costa Rica sur, Coiba, golfo de Panamá, y Buenaventura (Colombia). Los valores de diversidad genética para todos los loci fueron altos (HO = 0.820), consistentes con otras investigaciones relizadas en L. peru a lo largo del Pacífico oriental tropical. No se encontró evidencia significativa de desequilibrio de ligamiento, ni de Hardy-Weinberg. Se detectó un déficit general de heterocigotos que sugiere la presencia del efecto Wahlund en la muestra de estudio, visible principalmente en la región de Coiba y el golfo de Panamá. Lo anterior se refrenda mediante el modelo de aislamiento por distancia encontrado, el cual fue significativo (r = 0.6934 P = 0.037), en un rango geográfico reducido (actual estudio ≈1600 Km) que concuerda con otras investigaciones realizados en el Pacífico oriental tropical. Mediante el análisis de estructuración genética se hallaron valores pequeños, pero significativos de estructuración poblacional (FST = 0.027, P = 0.001), mismos que concuerdan con las pruebas de asignación individual STRUCTURE y ADCP. Esto en conjunto con la evidencia sólida de flujo de genes contemporáneo e histórico indica la presencia de una estructura metapoblacional con dinámica fuente-sumidero influenciada principalmente por dinámica oceanográfica. Asímismo, con base en los resultados obtenidos (fuente-sumidero) ..... The Pacific coast of Costa Rica, Panama, and Colombia (COPc-CRPC) is influenced by several regional and local marine current systems, together with highly dynamic and seasonally changing gyres. This makes up a series of environmental factors involved in the dispersion or retention of meroplankton eggs and larvae, as well as in dispersal or migration processes in marine species. The silk snapper or red snapper (Lutjanus peru) is a coastal (and insular) species with a reproductive biology highly dependent on certain environmental conditions that favor its r-type reproductive strategy. In addition, L. peru is a species of high socio-economic value throughout its total geographic range. In this context, the objective of this research is to determine the flow patterns and gene structure for L. peru by means of 13 microsatellite molecular markers. For this purpose, a total of 136 tissue samples were analyzed, mostly from artisanal fisheries, collected in different points of the Pacific coast of northern Costa Rica, southern Costa Rica, Coiba, Gulf of Panama, and Buenaventura (Colombia). Genetic diversity values for all loci were high (HO = 0.820), consistent with other research conducted on L. peru throughout the eastern tropical Pacific. No significant evidence of linkage disequilibrium or of departure from Hardy-Weinberg expectations were found. A general heterozygote deficit was detected suggesting the presence of the Wahlund effect in the study sample, present mainly in the Coiba region and the Gulf of Panama. The above is endorsed by the isolation by distance model found, which was significant (r = 0.6934; p = 0.037), in a reduced geographic range (current study ≈1600 km) that agrees with other research conducted in the tropical eastern Pacific. By genetic structuring analysis, small but significant values of population structuring (FST = 0.027, p = 0.001) were found, consistent with STRUCTURE and ADCP individual assignment tests. This together with the robust signatures of contemporary and historical gene flow reflect the presence of a metapopulation structure with source-sink dynamics influenced mainly by oceanographic dynamics that prime. Likewise, based on the results obtained (source-sink), we discuss the importance and the negative impact that can be caused by ignoring a metapopulation structure in the management measures of a species of great socio-economic importance for the region, such as Lutjanus peru. | |
| CICESE | |
| 2022 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Molina Quirós, J.L. 2022. Diversidad y flujo génico del pargo seda (Lutjanus peru) en la costa Pacífica de Costa Rica, Panamá y Colombia, mediante marcadores moleculares de microsatélite. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 60 pp. | |
| OCEANOGRAFÍA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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| tesis_José Luis Molina Quirós_02 junio 2022.pdf | Versión completa de tesis | 2.36 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |