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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3757| Edad, filogenia y ciclo de vida: Factores que moldean la composición de la microbiota intestinal en la foca de puerto (Phoca vitulina richardii) Age, phylogeny and life cycle: factors shaping the gut microbiota composition in harbor seals (Phoca vitulina richardii) | |
| ARLETTE MARIMAR PACHECO SANDOVAL | |
| María Asunción Lago Lestón Yolanda Schramm Urrutia | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| foca de puerto del Pacífico, microbiota del intestino, pinnípedos, centinela ambiental Pacific harbor seal, gut microbiota, pinnipeds, environmental sentinel | |
| Los microorganismos desempeñan un papel fundamental en la fisiología y la salud de los animales. A pesar de su importancia, la información sobre la microbiota de los mamíferos marinos es escasa. Conocer los factores naturales que influyen en la composición y función de la microbiota es crucial para entender la influencia de los microorganismos en los animales. Mediante la secuenciación del gen 16S ARNr (V4), este estudio evaluó el efecto del ciclo anual, el sexo, la edad y la filogenia en la microbiota intestinal de las focas de puerto del Pacífico (Phoca vitulina richardii). Se colectaron muestras fecales de focas y otros pinnípedos que habitan en México y se utilizó RStudio para realizar análisis de diversidad, abundancia diferencial e inferencias funcionales. Con respecto al efecto del ciclo anual, los cambios en la composición y función de la microbiota se relacionaron con diferencias en requerimientos energéticos y periodos de ayuno. Los microorganismos responden a cambios en el metabolismo energético y proporcionan nutrientes fundamentales en periodos de escasa alimentación. Estos hallazgos resaltan la importancia de la microbiota en la fisiología de las focas de puerto. El sexo tiene un impacto mínimo en la composición microbiana del intestino debido al bajo dimorfismo sexual y a la alta variabilidad intrasexual de las focas. La influencia de la localidad en la microbiota, se relacionó con cambios en el consumo de presas y a una exposición a diferentes fuentes microbianas. La principal causa de las variaciones microbianas relacionadas con la edad fueron las diferencias en la dieta. A medida que las focas crecen, el grupo núcleo se reduce y la diversidad microbiana aumenta. Las hembras adultas y las crías tuvieron mayores similitudes microbianas que los machos adultos con crías. De acuerdo al estudio de las funciones de la microbiota, las crías estaban transitando de una dieta basada en leche a una sólida. Además, las vías metabólicas relacionadas con una drástica pérdida de peso y masa corporal, indicaron un mayor estrés metabólico en las crías a finales de la temporada de crianza, cuando las crías son destetadas y comienzan a ayunar. Aunque la filogenia fue un factor importante en la microbiota del intestino, similitudes en la dieta o en los ciclos anuales conllevan a tener una microbiota similar. La microbiota de los pinnípedos responde a preferencias alimenticias y necesidades energéticas diferentes. En comparación con las demás especies ... Microorganisms play important roles in animals' physiology and health. Despite its importance, information on marine mammals' microbiota is scarce. Knowing the natural factors that influence the microbiota composition and function is crucial to understanding how microorganisms affect animals. By sequencing the V4 region of the 16S rRNA gene, this study evaluated the impact of the annual cycle, sex, age, and phylogeny on the gut microbiota of Pacific harbor seals (Phoca vitulina richardii). Fecal samples were collected from seals and other pinnipeds inhabiting Mexico, and RStudio was used to perform diversity, differential abundance, and functional inferences analyses. Regarding the effect of the annual cycle, variations in energy requirements and fasting periods were correlated with changes in the composition and function of the microbiota. Microbes can adapt to variations in energy metabolism and supply vital nutrients when food is scarce. These findings highlight the importance of the microbiota in the harbor seal's physiology. Sex has a minimal impact on gut microbial composition due to a slight sexual dimorphism and high intrasexual variability of harbor seals. The effect of locality on the microbiota was related to changes in prey and exposure to different microbial sources. The primary cause of age-related microbial variations was diet differences. As seals grow, the core microbiota shrinks, and microbial diversity increases. Adult females and pups had more microbial similarities than adults males and pups. According to the study of the microbiota's function, pups were transitioning from a milk-based diet to a solid one. Additionally, metabolic pathways related to a dramatic weight loss and body mass indicated higher metabolic stress in pups in the late breeding season, when they are weaned and start fasting. Although phylogeny was important in gut microbial composition, similarities in species' diets or annual cycles lead to similar microbiota. Pinnipeds' microbiota adapts to different dietary demands and energy requirements. Compared to the other species, Pacific harbor seals and Guadalupe fur seals had the highest abundance of potentially harmful microorganisms. Harbor seals can serve as an environmental sentinel for the Baja California coast by by studying its gut microbiota. Due to their sedentary and coastal lifestyle, this species can provide critical information about the local environment. Therefore, potentially harmful bacteria in the seals | |
| CICESE | |
| 2022 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| Pacheco Sandoval, A.M. 2022. Edad, filogenia y ciclo de vida: Factores que moldean la composición de la microbiota intestinal en la foca de puerto (Phoca vitulina richardii). Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 134 pp. | |
| DESARROLLO ANIMAL | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ciencias de la Vida |
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| tesis_Arlette Marimar Pacheco Sandoval_20 sep 2022.pdf | Versión completa de la tesis | 9.76 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |