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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3847| Análisis de la abundancia de Lobos marinos (Zalophus californianus), condición corporal, caracterización de la microbiota anal y detección de agentes zoonóticos en la Región de las Grandes Islas Analysis of the abundance of sea lions (Zalophus californianus), body condition, characterization of the anal microbiota, and detection of zoonotic agents in the Region of the Large Islands | |
| DAVID RAMIREZ DELGADO | |
| Alexei Fedorovish Licea Navarro | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Microbiota anal, Crías de Lobo marino de California, Z. californianus, golfo de California, tendencia poblacional. Ana microbiota, Sea lion pups, Z. californianus, gulf of California, Population trending | |
| Empleando el registro de conteos de abundancia de Z. californianusrealizados por el personal del APFF IGC BC (CONANP) se analizó la tendencia de la abundancia por estadio ontogénico, y con base a losdatos morfométricos de crías de la misma especie se obtuvo el índice de condición corporal para un periodo de 12 años, y se examinó si la TSM podría ser un factor coadyuvante con el índice mencionado; además se obtuvieron muestra de mucosa anal de este mismo estadio para determinar mediante secuenciación masiva las especies bacterianas que conformaron la microbiota para el año 2018, mediante herramientas bioinformáticas se asignaron las secuencias genéticas aisladas con secuencias de referencia genómicas; una vez obtenidas dichas secuencias se realizó la predicción metabólica funcional para la detección de las rutas metabólicas teóricas asociadas a dicha microbiota, además se realizó una búsqueda de secuencias congruentes con especies bacterianas zoonóticas que estuvieron presentes en dichas muestra. Los estudios realizados en esta tesis se llevaron a cabo con la finalidad de aportar información puntual en 6 loberas de la región central del golfo de California y que pueda ser de apoyo para los organismos de conservación y salud ecosistémica para esclarecer la tendencia decreciente de la población de lobos marinos en la región de las grandes Islas cercanas a la costa de Baja California. Los resultados encontrados mostraron que estas loberas muestran también una tendencia negativa en abundancia, pero solo para ciertos estadios ontogénicos y que entre loberas existen diferencias de comportamiento tanto en abundancia como con respecto a la tendencia de índice de desarrollo corporal en crías, además la mayoría de las loberas no mostraron una relación lineal entre el ICC y la TSM, a excepción de la lobera Rasito, lo que podría ser explicado por las variaciones oceanográficas de las diferentes regiones del GC. Con respecto a la composición de la microbiota detectada se observó que a nivel de phylum existe predominio de Proteobacteria y que consecuentemente la familia Enterobacteriaceae, es también la más abundante para la mayoría de las loberas. La diversidad bacteriana entre loberas fue estadísticamente diferente, como lo evidenció la prueba T de Hutcheson para el índice de Shannon. También se detectaron secuencias congruentes con agentes zoon ... The work produced in this thesis was carried out to provide specific information in 6 colonies of the central region of the gulf of California that can be of support for conservation and ecosystem health organizations to clarify the decreasing trend of the population of sea lions in the Midriff region near the coast of Baja California. The abundance trend by ontogenetic stage was analyzed with the record of abundance counts of Z. californianus carried out by the APFF IGC BC (CONANP) staff, and based on the morphometric data of offspring of the same species, the body condition index was obtained for 12 years. The relationship between the SST and the body condition index was examined. In addition, massive sequencing of anal mucosa samples of offspring sampled in 2018 was obtained to determine the bacterial species that are integrated into the microbiota. The isolated genetic sequences were assigned with genomic reference sequences using bioinformatics tools. The theoretical metabolic pathways associated with the microbiota was estimated. In addition, a search was carried out for sequences consistent with zoonotic bacterial species that were present in a sample. The results showed that the sea lion colonies show a negative trend in abundance for certain ontogenetic stages, and there are behavioral differences between colonies. A difference in the body development index trend was observed in most populations. The rookeries did not show a linear relationship between the ICC and the SST, except for the Rasito rookery, which the oceanographic variations of the different regions of the GC could explain. Regarding the composition of the detected microbiota, it was observed that at the phylum level, there is a predominance of Proteobacteria and that, consequently, the Enterobacteriaceae family is also the most abundant for most sea lion colonies. The bacterial diversity between colonies was statistically different, as evidenced by Hutcheson's T test for the Shannon index. Congruent sequences with zoonotic agents relevant to the health of the species under study, such as Otariodibacter sp., and sequences of bacteria considered to be from other animal species, such as Ornithobacterium sp., were also detected. Regarding zoonotic bacteria, sequences consistent with pathogens of interest in public health were detected, of which the detection of sequences consistent with B. anthracis stands out, although it was only in a single colony and with a very low frequency of ... | |
| CICESE | |
| 2023 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| Ramírez Delgado, D. 2023. Análisis de la abundancia de Lobos marinos (Zalophus californianus), condición corporal, caracterización de la microbiota anal y detección de agentes zoonóticos en la Región de las Grandes Islas. Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 166 pp. | |
| PISCICULTURA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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| tesis_David Ramírez Delgado_08 feb 2023 (1).pdf | Versión completa de la tesis | 7.21 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |