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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3859| Conectividad genética entre provincias del Golfo de México, de larvas y adultos de Bothus robinsi Genetic connectivity between Gulf of Mexico provinces, of B. robinsi larvae and adults | |
| JOSE MANUEL MORALES PULIDO | |
| CLARA ELIZABETH GALINDO SANCHEZ SYLVIA PATRICIA ADELHEID JIMENEZ ROSENBERG | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Dispersión colectiva, conectividad, pez plano, dispersión larval, Pleuronectiformes Collective dispersal, connectivity, flatfish, larval dispersal, Pleuronectiforms | |
| Para generar una visión más completa de la conectividad (intercambio de individuos entre poblaciones) de organismos marinos como peces, es necesario tomar en cuenta los procesos en su historia de vida que incluye la dispersión de larvas y adultos. A partir de las larvas en tránsito, se puede obtener la información genética potencial capaz de influir en la diversidad y estructura genética de la población adulta. A partir de los adultos, se obtiene la información genética resultante de eventos de dispersión larval exitosos de múltiples cohortes. El lenguado Bothus robinsi es un organismo cuyas larvas pelágicas permanecen varios meses en el plancton, lo que promueve la conectividad entre provincias del golfo de México (GM). Para abordar su estudio, es necesario generar información ecológica y distinguir taxonómicamente sus larvas, dado que debido a su similitud morfológica con las de Bothus ocellatus, éstas no pueden ser identificadas morfológicamente durante el periodo larval. Dado lo anterior, el primer objetivo de este estudio fue generar un registro de distribución y abundancia larval, basado en identificaciones moleculares. Posteriormente, se generó información genética a partir de larvas y adultos para corroborar la existencia de conectividad genética entre provincias, además de probar la hipótesis de dispersión colectiva de larvas. Las larvas fueron muestreadas en el GM, durante el verano (2015 y 2017) y fueron clasificadas como Bothus spp, de acuerdo a los caracteres morfológicos. Para la identificación molecular, se secuenció el gen del citocromo oxidasa I (COI) de 126 individuos y se comparó con la secuencia más similar en la base de datos de GenBank y del Barcode of Life Data. Para la construcción de árboles filogenéticos se utilizó el software MEGA. A través de la técnica de ddRADSEQ se genotiparon 1,034 polimorfismos de nucleótido simple de larvas de B. robinsi obtenidas en la bahía de Campeche, en el este y norte del GM, y de adultos de la plataforma continental de Florida. Se realizaron comparaciones de Fst-pareado, análisis de componentes principales (ACP), análisis discriminantes de componentes principales (ADPC), y un análisis en el software Structure. Además, se determinó el parentesco, entre larvas y adultos, con el software COLONY. Como resultado, se identificaron molecularmente 21 larvas de B. ocellatus y 105 de B. robinsi. La distribución geográfica de ambas especies fue similar, pero la abundancia de B. robinsi fue mayor que la de B... To understand the connectivity (exchange of individuals between populations) of marine organisms like fish, we need to consider their life history and the dispersal as larvae and as adults. Larvae in transit can provide a representation of the genetic information that can potentially influence the genetic diversity and structure of the population. The adults’ genetic information summarizes multiple generations and cohorts of successful larval dispersal events. The flounder Bothus robinsi has a long pelagic larval duration that lasts for several months and that promotes connectivity between distinct provinces from the Gulf of Mexico (GoM). To study this topic is necessary to generate information about larval ecology and to differentiate the larvae taxonomically because is not possible to morphologically separate them from the larvae of B. ocellatus. The first goal of the study was to generate information about the larval distribution and abundance, based on molecular identifications. Additionally, genetic information from larvae and adults was generated to corroborate the existence of genetic connectivity among provinces, besides test the hypothesis of collective larval dispersion. Larvae were sampled in the GoM, during two summer seasons (2015 and 2017), and they were classified as Bothus spp, based on the morphological characteristics. The cytochrome oxidase I (COI) gene was sequenced in 126 larvae and compared with the most similar sequences in GenBank and the Barcode of Life Data databases to conduct a molecular identification. Phylogenetic trees were built with the software Mega. ddRADSEQ was used to genotype 1,034 single nucleotides polymorphic sites from B. robinsi larvae sampled in the waters from the Bay of Campeche, the eastern and northern GoM, and adults sampled on Floridas’ continental shelf. The genetic analysis performed included paired-Fst comparations, principal components analysis (PCA), discriminant analyses of principal components (DAPC), and Structure analysis. Also, a sibship evaluation was performed with the software COLONY. As a result, 21 larvae were identified as B. ocellatus and 105 as B. robinsi. Both species’ geographic distribution was similar, but B. robinsi abundance was higher than B. ocellatus in contrast to previous studies. No significant heterogeneity among regions was observed (paired-Fst 0.028-0.06, p-values>0.05), furthermore, the PCA, DAPC, and Structure analysis indicated genetic homogeneity, while full-sibs or ... | |
| CICESE | |
| 2023 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| Morales Pulido, J.M. 2023. Conectividad genética entre provincias del Golfo de México, de larvas y adultos de Bothus robinsi. Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 85 pp. | |
| OTRAS | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ciencias de la Vida |
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| tesis_José Manuel Morales Pulido_28 mar 2023.pdf | Versión completa de la tesis | 3.16 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |