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Caracterización de la comunidad microbiana asociada a Porites panamensis (Scleractinia: Poritidae), en Bahía de los Ángeles, Baja California
Characterization of the microbial community associated with Porites panamensis (Scleractinia: Poritidae), in Bahia de los Angeles, Baja California.
Evelyn López García
RAFAEL ANDRES CABRAL TENA
MIGUEL ANGEL MARTINEZ MERCADO
Acceso Abierto
Atribución
Microbioma, Porites panamensis, condiciones ambientales subóptimas, metabarcoding, estabilidad
microbiome, Porites panamensis, suboptimal environmental conditions, metabarcoding, stability
Los arrecifes coralinos son ecosistemas cruciales en la ecología de los océanos. Sin embargo, se enfrentan a una crisis global impulsada por factores antropogénicos y el cambio climático, lo que ha provocado su degradación, así como un aumento en las enfermedades en los corales. Se ha observado que los corales viven en simbiosis con diversos microorganismos eucariotas y procariotas denominados colectivamente microbioma coralino. En específico, se ha reportado que las bacterias y arqueas contribuyen al suministro de nutrientes y a la protección de patógenos de los corales, brindándoles resistencia ante enfermedades o blanqueamiento, además de contribuir a una mayor resiliencia de los corales frente a condiciones ambientales extremas. Esta investigación se enfoca en caracterizar la comunidad de bacterias y arqueas del coral Porites panamensis en Bahía de los Ángeles, Baja California (BLA) un hábitat con condiciones ambientales subóptimas para el desarrollo de corales zooxantelados, además de ser el límite de distribución latitudinal de la especie. Este estudio se realizó en dos sitios con diferencias oceanográficas y en temporadas ambientales contrastantes. Se tomaron muestras de 5 colonias de cada sitio, en 2 temporadas ambientales y mediante la técnica de metabarcoding, se amplificó la región V4 del gen 16S ARN. El microbioma de Porites panamensis mostró estabilidad tanto en su estructura como en su composición. Las familias dominantes fueron Flavobacteriaceae, SAR116 clade, Rhodobacteraceae, Chlorobiaceae y Nitrosopumilaceae. No se observaron diferencias significativas en la diversidad alfa entre los sitios y temporadas, medida a través del índice de Shannon y la diversidad filogenética de Faith. Además, el análisis de PERMANOVA reveló que no hubo diferencias significativas en la comunidad microbiana de P. panamensis entre los diferentes sitios ni temporadas. Estos resultados sugieren que la estabilidad del microbioma de P. panamensis podría ser el reflejo de la adaptación a las condiciones ambientales presentes en BLA.
Coral reefs are crucial ecosystems in the ecology of the oceans. However, they face a global crisis driven by anthropogenic factors and climate change, leading to their degradation and increased coral diseases. Corals have been observed to live in symbiosis with some eukaryotic and prokaryotic microorganisms called the coral microbiome. Bacteria and archaea contribute to the supply of nutrients and the protection of corals from pathogens, providing them with resistance to diseases or bleaching, and contributing to the resilience of corals against extreme environmental conditions. This research focuses on characterizing the bacterial and archaeal community of the coral Porites panamensis in Bahia de los Angeles, Baja California (BLA), an habitat with suboptimal environmental conditions for the development of zooxanthellate corals, in addition to being the limit of latitudinal distribution of the species. This study compares two sites with oceanographic differences and contrasting environmental seasons. Samples were taken from 5 colonies at each site in 2 environmental seasons, and using the metabarcoding technique, the V4 region of the 16S rRNA gene was amplified. The Porites panamensis microbiome showed stability in its structure and composition. The dominant families were Flavobacteriaceae, SAR116 clade, Rhodobacteraceae, Chlorobiaceae, and Nitrosopumilaceae. There were no significant differences in alpha diversity between sites and seasons, as measured by the Shannon index and Faith's phylogenetic diversity. Additionally, PERMANOVA analysis revealed no significant differences in the microbial community of P. panamensis between different sites or seasons. These results suggest that the stability of the P. panamensis microbiome may reflect the adaptation to the environmental conditions present in BLA.
CICESE
2024
Tesis de maestría
Español
López García, E. 2024. Caracterización de la comunidad microbiana asociada a Porites panamensis (Scleractinia: Poritidae), en Bahía de los Ángeles, Baja California. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 72 pp.
PROCESOS MICROBIANOS
Aparece en las colecciones: Tesis - Ecología Marina

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