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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/4183| Análisis transcriptómico de la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus) bajo condiciones térmicas oscilatorias en dos localidades de la península de Baja California Transcriptomic analysis of the sea Lion’s Paw Nodipecten subnodosus under thermal oscillatory conditions in two localities of the Baja California peninsula | |
| Giselle Moreno López | |
| PAULINA MEJIA RUIZ CLARA ELIZABETH GALINDO SANCHEZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Genómica funcional, plasticidad fenotípica, RNA-Seq, expresión génica, biología molecular, Nodipecten subnodosus Functional genomics, phenotypic plasticity, RNA-seq, gene expression, molecular biology, Nodipecten subnodosus | |
| El aumento de la temperatura global es uno de los principales factores de estrés en los organismos ectotérmicos los cuales podrían verse afectados en aspectos como la inmunidad, tasa metabólica y demanda de oxígeno. Sin embargo, la adaptación de las especies marinas ante estas condiciones es aún desconocida. Bivalvos como la almeja mano de león, Nodipecten subnodosus, son importantes en la estructura de los ecosistemas marinos y en la acuicultura, sin embargo, su sobrevivencia se ve amenazada por los futuros escenarios de cambio climático. La plasticidad fenotípica, capacidad genética para producir diferentes fenotipos según el ambiente, podría influir en la adaptación de los organismos a estas nuevas condiciones. Mediante estudios transcriptómicos, se puede obtener información que permite entender cómo las fluctuaciones térmicas afectan su expresión génica. En este trabajo se analizaron dos poblaciones genéticamente distintas de N. subnosodus, provenientes de reproductores de Laguna Ojo de Liebre (LOL) y Bahía de los Ángeles (BLA), donde los organismos crecieron bajo las mismas condiciones en LOL, y posteriormente fueron expuestos a un bioensayo con condiciones térmicas oscilatorias. Mediante el transcriptoma de las branquias se observaron que los patrones de expresión entre las poblaciones fueron distintos. Mientras que en BLA se observaron diferencias en los procesos biológicos relacionados con la fosforilación oxidativa y respuesta del AMPc, así como metabolismo de vitamina B6 y de aminoácidos, en LOL se observaron diferencias en los procesos del procesamiento del preARNr y de la biogénesis del ribosoma, así como transporte de proteínas y biosíntesis de aminoácidos. Los resultados sugieren que existen diferencias en la respuesta de las poblaciones ante los cambios de temperatura y que probablemente está dada por la plasticidad fenotípica adaptativa. Este trabajo posee información crucial para entender la biología molecular de esta especie dado que sirven como base para caracterizar los procesos biológicos y vías metabólicas ante el calentamiento global The increase in global temperature is one of the main stress factors for ectothermic organisms, which could be affected by aspects such as immunity, metabolic rate, and oxygen demand. However, the adaptation of marine species to these conditions still needs to be discovered. Bivalves like the lion's paw scallop, Nodipecten subnodosus, are essential in the structure of marine ecosystems and aquaculture; however, their survival is threatened by future climate change scenarios. Phenotypic plasticity, the genetic ability to produce different phenotypes depending on the environment, could influence the adaptation of organisms to these new conditions. Through transcriptomic studies, it is possible to obtain information that helps understand how thermal fluctuations affect gene expression. In this study, two genetically distinct populations of N. subnodosus were analyzed, originating from broodstock in Laguna Ojo de Liebre (LOL) and Bahía de los Ángeles (BLA), where the organisms grew under the same conditions in LOL. They were later exposed to a bioassay with oscillating thermal conditions. The transcriptome of the gills revealed that the expression patterns between the populations differed. In BLA, differences were observed in biological processes related to oxidative phosphorylation and cAMP response, as well as vitamin B6 and amino acid metabolism, while in LOL, differences were observed in processes related to pre-rRNA processing and ribosome biogenesis, as well as protein transport and amino acid biosynthesis. The results suggest differences in the response of the populations to temperature changes due to adaptive phenotypic plasticity. This work provides crucial information for understanding the molecular biology of this species, as it serves as a basis for characterizing biological processes and metabolic pathways in response to global warming. | |
| 2024 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Moreno López, G. 2024. Análisis transcriptómico de la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus) bajo condiciones térmicas oscilatorias en dos localidades de la península de Baja California.Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 75 pp. | |
| ZOOLOGÍA MARINA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ciencias de la Vida |
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| tesis_Giselle Moreno López_20 agosto 2024.pdf | Descripción completa de la tesis. | 4.17 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |