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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/688| Patrones filogenéticos del género Mustelus en el Pacífico nororiental Phylogenetic patterns of the genus Mustelus in the northeast Pacific | |
| Mariana Ronalda Ferrera Rodríguez | |
| AXAYACATL ROCHA OLIVARES Juan Carlos Pérez Jiménez | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Northeast Pacific,Shark,Phylogenetic analysis,Pacífico nororiental,Ciencias del mar,Molecular systematics,Análisis filogenético,Tiburón,Mustelus,Sistemática molecular,Marine sciences | |
| El género Mustelus está constituido por aproximadamente 27 especies costeras. Debido a su morfología poco variable y al traslape de los caracteres comúnmente utilizados en la identificación de tiburones, su sistemática y taxonomía es considerada problemática. Al igual que en otras especies de tiburones los estudios filogenéticos son escasos. En el presente estudio, se realizó una reconstrucción filogenética de 17 especies de Mustelus incluyendo a las especies presentes el Pacífico nororiental M. californicus, M. lunulatus, M. henlei y M. albipinnis, esta última de reciente descripción. Para ello se usaron secuencias de ADN de los genes mitocondriales ND2 y ND4 (Nicotinamida Adenina Dinucleotido Deshidorgenasa), y de los nucleares RAG1 (gen nuclear activador de recombinación) e ITS2 (espaciador transcrito interno 2). El análisis se hizo mediante los métodos de neighbor joining (NJ), máxima parsimonia (MP), máxima verosimilitud (MV) y análisis bayesianos que incluye el cálculo de los tiempos de divergencia. El análisis filogenético obtenido con los genes ND2 y ND4 resolvió satisfactoriamente la mayoría de las relaciones entre las especies, lo que indica que estos marcadores son adecuados para resolver divergencias recientes. Respecto a las especies del Pacífico M. henlei y M. albipinnis son filogenéticamente más cercanas a M. canis y M. norrisi presentes en el Atlántico, mientras que M. californicus y M. lunulatus son especies hermanas concordando con el uso de hábitat. La resolución filogenética con los marcadores nucleares fue menor, sin embargo se corroboraron algunos patrones obtenidos en la filogenia de genes mitocondriales. La estimación de los tiempos de divergencia, indican una separación de 18 millones de años (m.a) para los dos clados principales, mientras que dentro de cada clado la divergencia se dio entre los 4 y 8 m.a para la mayoría de las especies. Adicionalmente se estimó la diversidad nucleotídica de los cuatro genes en la que se obtuvieron valores promedio relativamente bajos π=0-0.0058 para los genes mitocondriales y de igual manera para los genes nucleares π=0-0.67. The genus Mustelus includes nearly 27 coastal species, because of their high morphological similarity and overlap of morphometric and meristic characters commonly used in shark identification, its taxonomy and systematics are considered problematic. Like in other sharks, phylogenetic studies are scarce. Here we carried out a phylogenetic reconstruction of 17 species of Mustelus, including those distributed in the eastern Pacific: M. californicus, M. lunulatus, M. henlei, and the recently described M. albipinnis. Data consisted of DNA sequences from two mitochondrial genes ND2 (NADH dehydrogenase subunit 2) and ND4 (NADH dehydrogenase subunit 4), and two nuclear genes RAG1 (recombination-activating gene1) and ITS2 (internal transcribed spacer 2). Phylogenetic analyses were carried out using neighbor joining (NJ), maximum parsimony (MP), maximum likelihood (ML) and a Bayesian approach which includes divergence time estimation. The topology obtained with ND2 and ND4 resolve successfully nearly all relationships among species, suggesting that these genes are appropriated for recent divergence. These data supported the monophyly of M. henlei, M. albipinnis and the Atlantic species M. canis and M. norrisi, whereas M. californicus and M. lunulatus resulted as sister species, which agree with their habitat use. Although nuclear genes have less phylogenetic resolution, the nuclear trees are congruent with those from mitochondrial. The estimation of divergence times shows a divergence in two principal clades about 18 M.Y. Within each clade, divergence occurs between 4 and 8 M.Y. In addition we estimated nucleotide diversity (π), which resulted in low average levels π=0-0.0058 for mitochondrial genes and π=0-0.67 for nuclear genes. | |
| CICESE | |
| 2014 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Ferrera Rodríguez,M.R.2014.Patrones filogenéticos del género Mustelus en el Pacífico nororiental.Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.50 pp. | |
| PECES Y FAUNA SILVESTRE | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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