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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/735| Estructura genética poblacional de la sardina del Pacífico nororiental Sardinops sagax caeruleus Population genetic structure of the northeast pacific sardine Sardinops sagax caeruleus | |
| Carina Gutiérrez Flores | |
| AXAYACATL ROCHA OLIVARES | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Sardina del Pacífico,Sardinops sagax caeruleus,Estructura genética,Genetic structure,ADN mitocondrial,Mitochondrial DNA,Ciencias del mar | |
| La variabilidad fenotípica de la sardina Monterrey (Sardinops sagax caeruleus) en su rango de distribución sugiere la existencia de al menos dos stocks, uno a lo largo de la costa este del Pacífico y otro dentro del Golfo de California. En contraste, la variabilidad genética de un gen mitocondrial y de genes aloenzimáticos sugiere una población panmítica con amplio flujo genético. Es necesario emplear distintos marcadores con mayor resolución para elucidar el patrón genético y posible estructura poblacional de la sardina monterrey. En este trabajo se analizaron dos genes mitocondriales (NAD5 y NAD6) y 8 microsatélites en 475 sardinas colectadas a lo largo del Pacífico noreste y Golfo de California para analizar la arquitectura genética e identificar si los stocks de afinidad térmica propuestos por Félix-Uraga et al. (2004) están genéticamente diferenciados. Las fluctuaciones demográficas no han erosionado la diversidad genética de la sardina (h=0.95, n=299 y H=0.81, n=455) lo cual puede deberse a que los colapsos históricos no han sido lo suficientemente fuertes y/o al alto “efecto de almacenaje genotípico” de la especie. Un gradiente latitudinal donde la mayor diversidad haplotípica se espera en una “zona de refugio” bajo condiciones adversas no fue observado, lo cual sugiere un comportamiento complejo durante las fluctuaciones demográficas. Los análisis de estructura sugieren homogeneidad genética temporal y espacial (Φ<sub>ST</sub>=0.0098, p=0.27 en NAD5, Φ<sub>ST</sub>=0.0005, p=0.51 en NAD6, y R<sub>ST</sub>=-0.012, p=0.99 en microsatélites), y alto flujo genético. Asimismo, se observó homogeneidad genética entre los tres stocks de afinidad térmicas (Φ<sub>CT</sub>=0.0018, p=0.26 en NAD5 y Φ<sub>CT</sub>=0.008, p=0.34 en NAD6, R<sub>CT</sub> =-0.00487, p=0.83 en microsatélites), menos del 1% de la varianza total fue entre grupos. Nuestros resultados son consistentes con estudios previos basados en aloenzimas y citocromo b. La falta de correspondencia entre los modelos de estructura poblacional morfológicos, centros de desove y de afinidad térmica con estudios moleculares sugiere que las diferencias fenotípicas son producto de la alta plasticidad de la especie. Sin embargo, la ausencia de diferenciación genética entre sardinas colectadas a lo largo de su distribución actual no implica que, para fines pesqueros, se esté explotando la misma unidad de manejo. The phenotypic variability of the Pacific sardine (Sardinops sagax caeruleus) along its range of distribution suggests the existence of at least two stocks, one in the Northeast Pacific coast and another one in the Gulf of California. On the other hand, the genetic variation of one mitochondrial gene and enzyme loci of low variability suggested a single pancmitic population with high gene flow. Therefore, it is necessary to use different markers with more resolving power to elucidate the genetic patterns and possible genetic structure in the Pacific sardine. The goal of this study is to analyze the genetic architecture of the species and to identify if the stocks based on “thermal affinity” proposed by FélixUraga et al. (2004) are genetically differentiated. Two mitochondrial genes (NAD5 and NAD6) and 8 microsatellites were analyzed in 475 sardines collected throughout the Northeastern Pacific and Gulf of California. Demographic fluctuations have not eroded the genetic diversity of the sardine (h=0.95, n=299 and H=0.81, n=455), probably because the collapses have not been sufficiently strong and/or because its high "genotypic storage effect". A latitudinal cline, where the highest haplotypic diversity is expected in a "refuge zone" under adverse conditions was not observed, which suggests complex behavior of the species during demographic fluctuations. The analyses of genetic structure suggest spatial homogeneity (Φ<sub>ST</sub>=0.0098, p=0.27 in NAD5, Φ<sub>ST</sub>=0.0005, p=0.51 in NAD6, and R<sub>ST</sub>=-0.012, p=0.99 in microsatellites) and high values of gene flow. Genetic homogeneity was also observed among the three proposed stocks of thermal affinity (ΦCT=0.0018, p=0.26 in NAD5 and Φ<sub>CT</sub>=0.008, p=0.34 in NAD6, R<sub>CT</sub> =-0.00487, p=0.83 in microsatellites), less than 1% of the genetic variance was attributed among groups variation. These results are consistent with the results of previous studies of population structure based on allozymes and cytochrome b. The lack of correspondence among models of population structure based on morphology, demography, spawning centers and temperature affinities with molecular studies suggests that the phenotypic differences are product of the high plasticity of the species. However, the lack of genetic differentiation among sardines collected throughout their present distribution does not imply that, for fishery purposes, the same management unit or stock is currently being exploited from Canada to the Gulf of California. | |
| CICESE | |
| 2007 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Gutiérrez Flores,C.2007.Estructura genética poblacional de la sardina del Pacífico nororiental Sardinops sagax caeruleus.Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.102 pp. | |
| PECES Y FAUNA SILVESTRE | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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