Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/790| Variabilidad genética de la región control mitocondrial del pez arrecifal Thalassoma lucasanum en el Pacífico Tropical Mexicano Genetic variability of the mitochondrial control region of the reef fish Thalassoma lucasanum from the Mexican Tropical Pacific | |
| Patricia Abigail Domínguez Rivera | |
| AXAYACATL ROCHA OLIVARES | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Thalassoma lucasanum,ADNmt,Mutaciones,Ciencias del mar | |
| Los peces arrecifales juegan un papel determinante en varios procesos ecológicos de los ecosistemas arrecifales coralinos. Estudios genéticos de peces arrecifales alrededor del mundo han revelado que aunque pueden albergar altos niveles de diversidad genética mitocondrial, varias especies presentan huellas genéticas de fluctuaciones poblacionales históricas asociadas a cambios climáticos ocurridos durante periodos glaciales. Thalassoma lucasanum es una de las especies más abundantes y representativas de las comunidades arrecifales del Pacifico Tropical Mexicano (PTM). Por lo tanto, conocer sus niveles de variabilidad genética poblacional es relevante para entender los procesos ecológicos y evolutivos que le han permitido establecerse exitosamente en dichas comunidades. En este trabajo se cuantificaron los niveles de variabilidad genética mitocondrial de T. lucasanum provenientes de cinco comunidades arrecifales a lo largo del PTM. Se identificaron sólo siete haplotipos en 110 secuencias de la región control (366 pb). El haplotipo TL- 01 fue el predominante en todas las localidades presentándose en el 94% de los organismos. Los seis haplotipos restantes fueron privados y sólo difirieron de TL-01 en una sustitución. Esto resultó en los niveles más bajos de diversidad genética mitocondrial encontrados en un pez arrecifal (h=0.124 y π=0.000059). Para descartar la hipótesis de que dicha variabilidad fuera un artefacto resultado de la amplificación de pseudogenes mitocondriales translocados al núcleo (numts), se realizaron análisis de la estructura secundaria y del patrón mutacional de las secuencias obtenidas. La consistencia entre el patrón mutacional de las secuencias de T. lucasanum con el de la región control mitocondrial de otras especies congéneres, así como el mapeo y la estructura secundaria del gen ARNt-Prolina adyacente, permitieron descartar la hipótesis de numts. Al realizar análisis de demografía histórica se detectó la huella genética de eventos de expansión repentina en al menos tres localidades del PTM (Bahía de La Paz, Baja California Sur, Isla Isabel, Nayarit y Bahías de Huatulco, Oaxaca). Se propone que la demografía histórica, el sistema de apareamiento poligámico y las condiciones del hábitat han contribuido al mantenimiento de una baja variabilidad genética mitocondrial en la especie. Si la baja variabilidad observada en el ADN mitocondrial es también característica del genoma nuclear de T. lucasanum, se plantea que debería considerarse como una fuente de vulnerabilidad de la especie para enfrentar cambios ambientales futuros. Reef fishes play a fundamental role in many ecological processes of coral reef ecosystems. Genetic studies of reef fishes around the world have revealed that even though they may harbor high levels of mitochondrial genetic diversity, several species present genetic footprints of historical demographic fluctuations brought about by climatic changes during glacial periods. Thalassoma lucasanum is one of the most abundant and representative species in the reef communities of the Mexican Tropical Pacific (MTP). Therefore, determining its levels of population genetic variability is relevant to understanding the ecological and evolutionary processes that have enabled its successful establishment in these communities. In this study we quantified the levels of mitochondrial genetic variability of T. lucasanum from five reef communities along the MTP. Only seven haplotypes were detected among 110 sequences of the mtDNA control region (366 bp). Haplotype TL-01 was prevalent in all locations being found in 94% of the organisms. The remaining six haplotypes were private and differed from TL-01 by only one substitution. This resulted in the lowest levels of mitochondrial genetic diversity found in a reef fish (h = 0.124 and π = 0.000059). To reject the hypothesis of an artifact resulting from the amplification of mitochondrial pseudogenes translocated to the nucleus (numts), I analyzed the secondary structure and the mutational pattern of our sequences. The consistent mutational pattern of the T. lucasanum sequences with the control region of other congeners, as well as the physical mapping and secondary structure of the adjacent tRNA-Proline gene, allowed us to reject the hypothesis of numts amplification. Historical demographic analyses revealed the genetic footprint of sudden population expansion events in at least three locations in the MTP (Bahía de La Paz, Baja California Sur, Isla Isabel, Nayarit y Bahías de Huatulco, Oaxaca). I propose that the historical demography, the polygamous mating system and the habitat conditions have contributed to maintaining the low levels of mitochondrial genetic variability in the species. Should this level of depressed mitochondrial diversity be also found in the nuclear genome of T. lucasanum, it should be considered as a source of vulnerability for the species that would limit its ability to cope with future environmental change. | |
| CICESE | |
| 2011 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Domínguez Rivera,P.A.2011.Variabilidad genética de la región control mitocondrial del pez arrecifal Thalassoma lucasanum en el Pacífico Tropical Mexicano.Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.66 pp. | |
| PECES Y FAUNA SILVESTRE | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
Cargar archivos:
| Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
|---|---|---|---|---|
| 187021.pdf | Versión completa de la tesis | 32.14 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |