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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/80| Tamaño genómico de especies acuáticas de importancia económica y biológica en el Estado de Baja California Genome size of aquatic animal of economic and biological importance in Baja California | |
| Constanza del Mar Ochoa Saloma | |
| CARMEN GUADALUPE PANIAGUA CHAVEZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Acuicultura, Genómico, Genómico | |
| El tamaño genómico o valor C, es toda la cantidad de DNA en un set genómico haploide, el cual es expresado en picogramos (pg). El tamaño genómico es una de las características celulares más analizadas que permite entender varias funciones y características como el estatus genético de las poblaciones silvestres, la identificación de poliploidía y alteraciones a nivel cromosómico, entre otros. En los últimos años, ha crecido un gran interés en el conocimiento del estatus genético de especies de importancia económica y biológica en Baja California. Sin embargo, la información sobre el tamaño genómico de especies acuáticas de Baja California es nula. Por lo tanto, la determinación del tamaño genómico ayudará a complementar los estudios genéticos que proporcionan una mejor comprensión para mejorar el uso sustentable de los recursos pesqueros y mejorar la acuicultura, teniendo un impacto positivo en la producción pesquera y acuícola de la región. De esta manera, los objetivos de este trabajo fueron: (1) Identificar los estándares de referencia apropiados para el estudio de estos organismos, (2) evaluar el tamaño genómico en espermatozoides, sangre y hemolinfa de los animales de estudio y por ultimo (3) establecer la metodología más apropiada para el análisis de los organismos estudiados. Muestras de sangre, hemolinfa y esperma de 23 especies fueron colectadas y el DNA teñido con yoduro de propidio. Las muestras fueron analizadas en un citómetro de flujo Attune® Flow Cytometer con una configuración láser Azul/Violeta (488 y 405 nm respectivamente). Aproximadamente, 10,000 núcleos por muestra fueron analizados por triplicado. El tamaño genómico se calculó con una desviación estándar de 0.001. El rango del tamaño genómico (diploide) de las especies analizadas fue de 1.21 pg a 8.83 pg. El más pequeño (1.21 pg) se encontró en bacalao negro (Anoplopoma fimbria) y el más grande (8.83 pg) para el tiburón cobrizo (Carcharhinus brachyurus). No se encontraron diferencias significativas entre el tamaño genómico de los individuos de la misma especie (P > 0.5). El tamaño genómico de 16 de las especies analizadas fueron comparadas con el tamaño genómico reportado en la Base de Datos Internacional de Tamaño Genómico Animal (International animal genome size database). La diferencia encontrada en aquellas especies cuyo tamaño genómico si se encontraba reportado en la base de datos fue debido al tamaño de la muestra y la precisión del análisis utilizado. La información obtenida en este trabajo permitirá establecer la primera base de datos regional de tamaño genómico y la entrada a la base de datos de tamaño genómico internacional. The genome size of a cell is the total amount of DNA in the nucleus. This amount is constant for organisms of the same species and it differs among species. This characteristic makes the genome size a crucial parameter for genetic research on endemic aquatic species and for genetic manipulations in aquaculture species. Genome size assessments for aquaculture species is the most precise tool for identifying hybrids, polyploidy, and identifying sex when sex chromosomes exist. No previous research on genome size has been performed in Baja California. The objectives of this research were to (1) determine the genome size of aquatic animals with biological and economical importance in Baja California, (2), to identify the appropriate reference standards, and (3) to establish standard operating procedures for these species. Blood, hemolymph or sperm samples from 23 species were collected and nuclear DNA was stained with propidium iodide solution. Genome size was determined by flow cytometry using ~10,000 nuclei per sample in triplicate. The genome size was calculated with a 0.001 standard deviation. Genome size from all species analyzed ranged from 1.21 pg to 8.83 pg, with the smallest genome size found in sablefish (Anoploma fimbria) and the largest (8.83 pg) found in copper shark (Carcharhinus brachyurus). No significant differences among individuals of the same species were found (P menor a 0.05). Genome size from 16 target organisms were compared with the genome size reported in the International animal genome size database. Differences found between studied species and database was due to a highest sample size and acute analysis used in this study. This is the first study of genome size determined for aquatic animals in Baja California. The data generated establishes the foundation for the country of Mexico by virtue of these species of regional importance, and the data will be submitted to the international animal genome size database. | |
| 2015 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Acuicultura |
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