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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/85| Modelos de distribución potencial de Coccidioides spp. en Baja California Potential distribution models of Coccidioides spp. in Baja California. | |
| PAMELA OCAMPO CHAVIRA | |
| MERITXELL RIQUELME PEREZ | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Coccidioides, modelo de nicho ecológico, variables biológicas | |
| La coccidioidomicosis, también conocida como la fiebre del valle de San Joaquín, es una micosis pulmonar, cuya incidencia ha aumentado en los últimos años en las áreas endémicas de California y Arizona donde su registro epidemiológico es obligatorio. Esta enfermedad es causada por especies fúngicas pertenecientes al género Coccidioides y afecta a mamíferos incluyendo al humano. La detección del hongo a partir de muestras ambientales resulta una tarea difícil en parte, porque no se cuenta con suficiente información respecto a su nicho ecológico para poder llevar a cabo muestreos dirigidos. Se ha sugerido a los roedores como posibles reservorios, sin embargo su distribución no se ha tomado en cuenta para modelar la distribución potencial del hongo. En este trabajo se propone modelar la distribución potencial de Coccidioides spp. en los estados de Baja California, en México, y Arizona y California, en Estados Unidos, mediante modelos de nicho ecológico y sistemas de información geográfica, tomando en cuenta la distribución potencial de Chaetodipus fallax (ratón de abazones de San Diego), Dipodomys simulans (rata canguro de dulzura), Neotoma lepida (rata cambalachera desértica) y Peromyscus maniculatus (ratón ciervo), así como variables bioclimáticas y de suelo. Se utilizó el algoritmo Maxent para modelar la distribución potencial de Coccidioides spp. y se incorporó la distribución potencial de roedores siguiendo dos metodologías diferentes. Los resultados indican que la distribución potencial de al menos las cuatro especies de roedor Valley Fever is a mycosis, whose incidence has increased in the last years in the endemic regions of California and Arizona. The disease is caused by Coccidioides spp. and it affects mainly mammals, including humans. The detection of Coccidioides spp. from soil samples has been challenging, mostly because we lack information about its ecological niche, which makes it very difficult to perform directed sampling. It has been suggested that rodents act as reservoirs for the fungus; yet, rodent distribution has not been taken into account in previous models of the potential distribution of Coccidioides. Hence the main goal of this work was to include the potential distribution of Chaetodipus fallax (San Diego pocket mouse), Dipodomys simulans (Dulzura kangaroo rat), Neotoma lepida (Desert woodrat) and Peromyscus maniculatus (Deer mouse), as well as bioclimatic and soil variables, to model using Maxent and GIS the potential distribution of Coccidioides in the endemic states of Baja California in Mexico, and California and Arizona in the United States. Results obtained when using only abiotic variables showed that, when overlapping a map for California and Arizona showing counties with reported cases of Valley Fever, a good match between high probability of habitat suitability predicted by the model and counties with the highest incidence of the disease was obtained. In comparison with GARP generated models, in the model generated here with Maxent, the habitat suitability regions appeared more delimited, thus minimizing the | |
| CICESE | |
| 2016 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Investigadores | |
| Ocampo Chavira, P. 2016. Modelos de distribución potencial de Coccidioides spp. en Baja California. Tesis de Maestría: Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 67 pp. | |
| CIENCIAS DE LA VIDA | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ciencias de la Vida |
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| Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
|---|---|---|---|---|
| Tesis_Pamela_Ocampo_18oct_2016.pdf | Version completa de la tesis | 35.54 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |