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http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/769| Polimorfismo en el gen DQB del complejo principal de histocompatibilidad clase II en tursiones Tursiops truncatus del Golfo de México y Mar Caribe Major Histocompatibility Complex II DQβ gene polymorphism in bottlenose dolphin Tursiops truncatus from Gulf of Mexico and Caribbean Sea | |
| Jorge Ezequiel Montano Frías | |
| AXAYACATL ROCHA OLIVARES | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución | |
| Bottlenose dolphin,Polimorfismo,MHC Polymorphism,Gen DQB,Tursiops truncatus,Resistencia a patógenos,Pathogen resistance,Golfo de México,Mar Caribe,Ciencias del mar | |
| El Complejo Principal de Histocompatibilidad (MHC) es una familia multigénica que codificaglicoproteínas involucradas en el inicio de la respuesta inmune de los vertebrados. El nivel depolimorfismo de los genes MHC se encuentra estrechamente ligado a su función, por lo queniveles altos usualmente se asocian con una mayor capacidad inmune y protección delhospedero en contra de los patógenos. En esta tesis se analizaron secuencias del gen DQβ(exón 2) del MHC-II de 48 tursiones Tursiops truncatus procedentes de 5 localidades costeras del sur del Golfo de México y Mar Caribe. La amplificación parcial del exón 2 DQβ mediantereacción en cadena de la polimerasa (PCR) proporcionó secuencias de 172 pb que noexhibieron más de dos alelos en cada individuo genotipificado (genotipo diploide). Sedetectaron 27 alelos Tutr-DQB* utilizando PHASE 2.1.1, un algoritmo Bayesiano diseñadopara la reconstrucción de haplotipos ambiguos en los individuos heterocigóticos. Estos alelosmostraron señales de homología con las secuencias DQB1 de los cetáceos, especialmente con aquellos de las familias Delphinidae, Phocoenidae e Iniidae. Las secuencias mostraron un alto valor de diversidad nucleotídica (π = 7%) y marcos de lectura ininterrumpidos, lo que esconsistente con loci MHC-II analizados en otros mamíferos relacionados (e.g. rumiantes). Laheterocigosidad encontrada en cada localidad varió entre 0.78 y 0.98, mientras que para todas las localidades fue 0.86. Los resultados sugieren la influencia de la selección estabilizadora (selección positiva Darwiniana) sobre este gen a través de largos periodos de tiempo evolutivo, reflejada en una alta proporción de sustituciones no sinónimas en los codones involucrados en la fijación del péptido antigénico (PBR d<sub>N</sub> = 28.5%, p<0.05) y un alto valor promedio de la razón entre sustituciones no sinónimas y sinónimas (d<sub>N</sub> / d<sub>S</sub> = 6.4). Además, se observó un patrón de evolución trans-específico dentro del suborden Odontoceti (cetáceos dentados) al encontrar alelos compartidos entre taxa divergentes. En general, el nivel de polimorfismo encontrado en estos tursiones fue alto en comparación con otras poblaciones de cetáceos de hábitos costeros, lo que sugiere la exposición a una alta diversidad de patógenos en su hábitat. The Major Histocompatibility Complex (MHC) comprises a large multigene family coding forglycoproteins that play a key role in the induction of immune responses in vertebrates. The highlevel polymorphism observed in MHC loci is explained in terms of its protector functionagainst a number of pathogens. In this study, the exon-2 of the DQβ gene (MHC-class II) wasanalyzed for 48 bottlenose dolphins Tursiops truncatus from five localities of the southern Gulfof México and Caribbean Sea. Partial amplification of the DQβ locus (exon 2) comprising172 bp sequences showed no more than two alleles per individual (diploid genotype). Overall,27 Tutr-DQB* alleles were detected using PHASE 2.1.1, a Bayesian algorithm for haplotypereconstruction in heterozygous individuals. These alleles showed shared homology withcetacean DQB1 sequences, especially those of the Delphinidae, Phocoenidae and Iniidae. Thesesequences showed high within-species and between-species nucleotide diversity (π = 7%) anduninterrupted reading frames consistent with functional class II loci found in related mammals(e.g. ruminants). Heterozygosity in each locality ranged from 0.78 to 0.98, and for all fivelocalities was 0.86. Significantly higher nonsynonimous divergence at sites coding for peptidebinding (PBR d<sub>N</sub> = 28.5%, p<0.05) and a high overall ratio non-synonymous to synonymoussubstitutions (d<sub>N</sub> / d<sub>S</sub> = 6.4) suggested that this locus was subject to balancing (positive Darwinian) selection over a long evolutionary time period. This evidence was supported by apattern of trans-specific allele sharing within the suborder Odontoceti (toothed whales).Overall, the level of polymorphism in the DQβ gene of these bottlenose dolphins was highcompared to other cetacean populations inhabiting coastal waters, suggesting exposure to ahigh diversity of pathogens in their habitat. | |
| CICESE | |
| 2009 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Montano Frías,J.E.2009.Polimorfismo en el gen DQB del complejo principal de histocompatibilidad clase II en tursiones Tursiops truncatus del Golfo de México y Mar Caribe.Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California.81 pp. | |
| PECES Y FAUNA SILVESTRE | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Ecología Marina |
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